Protein–RNA interactions for Protein: P20248

CCNA2, Cyclin-A2, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNA2P20248 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCNA2P20248 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCNA2P20248 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCNA2P20248 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CCNA2P20248 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCNA2P20248 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCNA2P20248 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCNA2P20248 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCNA2P20248 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCNA2P20248 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCNA2P20248 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCNA2P20248 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCNA2P20248 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCNA2P20248 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCNA2P20248 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CCNA2P20248 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CCNA2P20248 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CCNA2P20248 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCNA2P20248 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCNA2P20248 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCNA2P20248 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCNA2P20248 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCNA2P20248 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCNA2P20248 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCNA2P20248 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCNA2P20248 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCNA2P20248 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCNA2P20248 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCNA2P20248 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCNA2P20248 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCNA2P20248 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCNA2P20248 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCNA2P20248 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCNA2P20248 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCNA2P20248 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCNA2P20248 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCNA2P20248 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCNA2P20248 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCNA2P20248 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CCNA2P20248 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCNA2P20248 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCNA2P20248 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCNA2P20248 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCNA2P20248 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCNA2P20248 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCNA2P20248 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCNA2P20248 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCNA2P20248 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CCNA2P20248 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCNA2P20248 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCNA2P20248 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCNA2P20248 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCNA2P20248 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCNA2P20248 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCNA2P20248 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCNA2P20248 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCNA2P20248 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCNA2P20248 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCNA2P20248 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CCNA2P20248 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCNA2P20248 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCNA2P20248 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCNA2P20248 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CCNA2P20248 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCNA2P20248 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCNA2P20248 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCNA2P20248 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCNA2P20248 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCNA2P20248 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCNA2P20248 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCNA2P20248 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCNA2P20248 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCNA2P20248 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCNA2P20248 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCNA2P20248 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCNA2P20248 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCNA2P20248 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCNA2P20248 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCNA2P20248 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCNA2P20248 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCNA2P20248 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCNA2P20248 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCNA2P20248 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCNA2P20248 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCNA2P20248 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCNA2P20248 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCNA2P20248 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCNA2P20248 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCNA2P20248 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCNA2P20248 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCNA2P20248 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CCNA2P20248 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCNA2P20248 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCNA2P20248 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCNA2P20248 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCNA2P20248 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CCNA2P20248 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCNA2P20248 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CCNA2P20248 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CCNA2P20248 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms