Protein–RNA interactions for Protein: P19875

CXCL2, C-X-C motif chemokine 2, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL2P19875 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CXCL2P19875 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CXCL2P19875 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CXCL2P19875 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CXCL2P19875 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CXCL2P19875 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CXCL2P19875 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CXCL2P19875 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CXCL2P19875 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CXCL2P19875 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CXCL2P19875 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CXCL2P19875 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CXCL2P19875 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CXCL2P19875 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CXCL2P19875 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CXCL2P19875 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CXCL2P19875 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
CXCL2P19875 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CXCL2P19875 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CXCL2P19875 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CXCL2P19875 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CXCL2P19875 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CXCL2P19875 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CXCL2P19875 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CXCL2P19875 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
CXCL2P19875 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CXCL2P19875 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
CXCL2P19875 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CXCL2P19875 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CXCL2P19875 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CXCL2P19875 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CXCL2P19875 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CXCL2P19875 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CXCL2P19875 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CXCL2P19875 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CXCL2P19875 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CXCL2P19875 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CXCL2P19875 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CXCL2P19875 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CXCL2P19875 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CXCL2P19875 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CXCL2P19875 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CXCL2P19875 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CXCL2P19875 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CXCL2P19875 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CXCL2P19875 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
CXCL2P19875 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CXCL2P19875 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CXCL2P19875 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CXCL2P19875 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
CXCL2P19875 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CXCL2P19875 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CXCL2P19875 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CXCL2P19875 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CXCL2P19875 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CXCL2P19875 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CXCL2P19875 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CXCL2P19875 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CXCL2P19875 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CXCL2P19875 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CXCL2P19875 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CXCL2P19875 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CXCL2P19875 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CXCL2P19875 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CXCL2P19875 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CXCL2P19875 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CXCL2P19875 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CXCL2P19875 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CXCL2P19875 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CXCL2P19875 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CXCL2P19875 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CXCL2P19875 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CXCL2P19875 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CXCL2P19875 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CXCL2P19875 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CXCL2P19875 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CXCL2P19875 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CXCL2P19875 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CXCL2P19875 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CXCL2P19875 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CXCL2P19875 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CXCL2P19875 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CXCL2P19875 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CXCL2P19875 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CXCL2P19875 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CXCL2P19875 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
CXCL2P19875 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CXCL2P19875 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CXCL2P19875 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CXCL2P19875 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CXCL2P19875 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CXCL2P19875 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CXCL2P19875 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CXCL2P19875 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
CXCL2P19875 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CXCL2P19875 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CXCL2P19875 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CXCL2P19875 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CXCL2P19875 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
CXCL2P19875 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms