Protein–RNA interactions for Protein: P19387

POLR2C, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2CP19387 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
POLR2CP19387 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
POLR2CP19387 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
POLR2CP19387 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
POLR2CP19387 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
POLR2CP19387 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
POLR2CP19387 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
POLR2CP19387 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
POLR2CP19387 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
POLR2CP19387 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
POLR2CP19387 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
POLR2CP19387 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
POLR2CP19387 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
POLR2CP19387 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
POLR2CP19387 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
POLR2CP19387 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
POLR2CP19387 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
POLR2CP19387 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
POLR2CP19387 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
POLR2CP19387 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
POLR2CP19387 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
POLR2CP19387 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
POLR2CP19387 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
POLR2CP19387 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
POLR2CP19387 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
POLR2CP19387 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
POLR2CP19387 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
POLR2CP19387 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
POLR2CP19387 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
POLR2CP19387 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
POLR2CP19387 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
POLR2CP19387 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
POLR2CP19387 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
POLR2CP19387 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
POLR2CP19387 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
POLR2CP19387 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
POLR2CP19387 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
POLR2CP19387 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
POLR2CP19387 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
POLR2CP19387 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
POLR2CP19387 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
POLR2CP19387 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
POLR2CP19387 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
POLR2CP19387 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
POLR2CP19387 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
POLR2CP19387 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
POLR2CP19387 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
POLR2CP19387 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
POLR2CP19387 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
POLR2CP19387 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
POLR2CP19387 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
POLR2CP19387 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
POLR2CP19387 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
POLR2CP19387 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
POLR2CP19387 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
POLR2CP19387 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
POLR2CP19387 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
POLR2CP19387 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
POLR2CP19387 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
POLR2CP19387 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
POLR2CP19387 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
POLR2CP19387 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
POLR2CP19387 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
POLR2CP19387 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
POLR2CP19387 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
POLR2CP19387 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
POLR2CP19387 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
POLR2CP19387 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
POLR2CP19387 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
POLR2CP19387 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
POLR2CP19387 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
POLR2CP19387 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
POLR2CP19387 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
POLR2CP19387 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
POLR2CP19387 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
POLR2CP19387 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
POLR2CP19387 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
POLR2CP19387 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
POLR2CP19387 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
POLR2CP19387 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
POLR2CP19387 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
POLR2CP19387 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
POLR2CP19387 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
POLR2CP19387 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
POLR2CP19387 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
POLR2CP19387 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
POLR2CP19387 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
POLR2CP19387 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
POLR2CP19387 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
POLR2CP19387 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
POLR2CP19387 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
POLR2CP19387 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
POLR2CP19387 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
POLR2CP19387 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
POLR2CP19387 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
POLR2CP19387 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
POLR2CP19387 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
POLR2CP19387 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
POLR2CP19387 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
POLR2CP19387 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms