Protein–RNA interactions for Protein: P16220

CREB1, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB1P16220 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CREB1P16220 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CREB1P16220 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CREB1P16220 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CREB1P16220 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CREB1P16220 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CREB1P16220 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CREB1P16220 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CREB1P16220 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CREB1P16220 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CREB1P16220 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CREB1P16220 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CREB1P16220 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CREB1P16220 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CREB1P16220 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CREB1P16220 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CREB1P16220 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CREB1P16220 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CREB1P16220 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CREB1P16220 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CREB1P16220 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CREB1P16220 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CREB1P16220 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CREB1P16220 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CREB1P16220 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CREB1P16220 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CREB1P16220 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CREB1P16220 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CREB1P16220 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CREB1P16220 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CREB1P16220 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CREB1P16220 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CREB1P16220 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CREB1P16220 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CREB1P16220 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CREB1P16220 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CREB1P16220 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CREB1P16220 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CREB1P16220 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
CREB1P16220 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
CREB1P16220 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CREB1P16220 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CREB1P16220 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
CREB1P16220 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CREB1P16220 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CREB1P16220 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CREB1P16220 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CREB1P16220 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CREB1P16220 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CREB1P16220 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CREB1P16220 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CREB1P16220 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CREB1P16220 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CREB1P16220 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CREB1P16220 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CREB1P16220 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CREB1P16220 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CREB1P16220 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CREB1P16220 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CREB1P16220 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CREB1P16220 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CREB1P16220 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CREB1P16220 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CREB1P16220 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CREB1P16220 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CREB1P16220 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CREB1P16220 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CREB1P16220 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CREB1P16220 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CREB1P16220 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CREB1P16220 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CREB1P16220 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CREB1P16220 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CREB1P16220 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CREB1P16220 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CREB1P16220 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CREB1P16220 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CREB1P16220 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CREB1P16220 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CREB1P16220 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CREB1P16220 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CREB1P16220 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CREB1P16220 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CREB1P16220 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CREB1P16220 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CREB1P16220 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CREB1P16220 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CREB1P16220 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CREB1P16220 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CREB1P16220 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CREB1P16220 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CREB1P16220 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CREB1P16220 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CREB1P16220 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CREB1P16220 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CREB1P16220 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CREB1P16220 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CREB1P16220 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CREB1P16220 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CREB1P16220 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms