Protein–RNA interactions for Protein: P11926

ODC1, Ornithine decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1P11926 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ODC1P11926 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ODC1P11926 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ODC1P11926 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ODC1P11926 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ODC1P11926 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ODC1P11926 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ODC1P11926 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ODC1P11926 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ODC1P11926 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ODC1P11926 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ODC1P11926 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ODC1P11926 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ODC1P11926 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ODC1P11926 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ODC1P11926 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ODC1P11926 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ODC1P11926 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ODC1P11926 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ODC1P11926 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ODC1P11926 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
ODC1P11926 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ODC1P11926 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
ODC1P11926 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
ODC1P11926 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ODC1P11926 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
ODC1P11926 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ODC1P11926 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ODC1P11926 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ODC1P11926 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ODC1P11926 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
ODC1P11926 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ODC1P11926 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ODC1P11926 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ODC1P11926 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ODC1P11926 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ODC1P11926 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ODC1P11926 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ODC1P11926 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ODC1P11926 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ODC1P11926 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ODC1P11926 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ODC1P11926 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ODC1P11926 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ODC1P11926 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ODC1P11926 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ODC1P11926 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ODC1P11926 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ODC1P11926 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ODC1P11926 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ODC1P11926 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ODC1P11926 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ODC1P11926 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ODC1P11926 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ODC1P11926 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ODC1P11926 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ODC1P11926 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ODC1P11926 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ODC1P11926 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ODC1P11926 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ODC1P11926 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ODC1P11926 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ODC1P11926 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
ODC1P11926 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ODC1P11926 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ODC1P11926 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
ODC1P11926 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ODC1P11926 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ODC1P11926 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ODC1P11926 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ODC1P11926 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ODC1P11926 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ODC1P11926 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
ODC1P11926 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
ODC1P11926 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ODC1P11926 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ODC1P11926 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ODC1P11926 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ODC1P11926 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ODC1P11926 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ODC1P11926 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ODC1P11926 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ODC1P11926 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ODC1P11926 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ODC1P11926 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ODC1P11926 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ODC1P11926 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ODC1P11926 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ODC1P11926 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ODC1P11926 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ODC1P11926 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ODC1P11926 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ODC1P11926 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ODC1P11926 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ODC1P11926 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ODC1P11926 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ODC1P11926 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ODC1P11926 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ODC1P11926 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ODC1P11926 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms