Protein–RNA interactions for Protein: P10071

GLI3, Transcriptional activator GLI3, humanhuman

Predictions only

Length 1,580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI3P10071 AC008438.1-201ENST00000507521 549 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GLI3P10071 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC21.31■■□□□ 1
GLI3P10071 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
GLI3P10071 AC090386.1-202ENST00000586610 469 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
GLI3P10071 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GLI3P10071 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GLI3P10071 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GLI3P10071 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GLI3P10071 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GLI3P10071 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GLI3P10071 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GLI3P10071 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GLI3P10071 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GLI3P10071 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GLI3P10071 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GLI3P10071 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GLI3P10071 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GLI3P10071 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GLI3P10071 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GLI3P10071 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GLI3P10071 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
GLI3P10071 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GLI3P10071 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GLI3P10071 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GLI3P10071 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GLI3P10071 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GLI3P10071 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GLI3P10071 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GLI3P10071 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GLI3P10071 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GLI3P10071 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GLI3P10071 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GLI3P10071 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
GLI3P10071 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GLI3P10071 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
GLI3P10071 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GLI3P10071 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GLI3P10071 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GLI3P10071 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
GLI3P10071 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GLI3P10071 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GLI3P10071 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC21.3■■□□□ 1
GLI3P10071 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GLI3P10071 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GLI3P10071 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GLI3P10071 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GLI3P10071 FAM3B-203ENST00000398647 864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GLI3P10071 FAM3B-204ENST00000398652 1125 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GLI3P10071 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GLI3P10071 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC21.3■■□□□ 1
GLI3P10071 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GLI3P10071 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC21.3■■□□□ 1
GLI3P10071 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GLI3P10071 CROCCP3-204ENST00000590118 574 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
GLI3P10071 AC008743.1-201ENST00000596350 813 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
GLI3P10071 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
GLI3P10071 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
GLI3P10071 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC21.3■■□□□ 1
GLI3P10071 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GLI3P10071 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GLI3P10071 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GLI3P10071 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GLI3P10071 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
GLI3P10071 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GLI3P10071 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GLI3P10071 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GLI3P10071 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
GLI3P10071 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GLI3P10071 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GLI3P10071 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GLI3P10071 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GLI3P10071 AC091390.4-201ENST00000484974 491 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
GLI3P10071 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC21.29■■□□□ 1
GLI3P10071 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC21.29■■□□□ 1
GLI3P10071 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC21.29■■□□□ 1
GLI3P10071 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GLI3P10071 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GLI3P10071 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GLI3P10071 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GLI3P10071 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
GLI3P10071 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GLI3P10071 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GLI3P10071 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GLI3P10071 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GLI3P10071 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GLI3P10071 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GLI3P10071 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC21.28■■□□□ 1
GLI3P10071 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GLI3P10071 LINC02028-203ENST00000443776 453 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
GLI3P10071 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GLI3P10071 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GLI3P10071 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GLI3P10071 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
GLI3P10071 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GLI3P10071 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC21.28■■□□□ 1
GLI3P10071 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC21.28■■□□□ 1
GLI3P10071 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GLI3P10071 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GLI3P10071 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GLI3P10071 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.5 ms