Protein–RNA interactions for Protein: P0C843

LINC00032, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00032, humanhuman

Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00032P0C843 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LINC00032P0C843 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LINC00032P0C843 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LINC00032P0C843 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LINC00032P0C843 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LINC00032P0C843 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LINC00032P0C843 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LINC00032P0C843 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LINC00032P0C843 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LINC00032P0C843 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LINC00032P0C843 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LINC00032P0C843 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LINC00032P0C843 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LINC00032P0C843 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LINC00032P0C843 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00032P0C843 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00032P0C843 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00032P0C843 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00032P0C843 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00032P0C843 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00032P0C843 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00032P0C843 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00032P0C843 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00032P0C843 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00032P0C843 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00032P0C843 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00032P0C843 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00032P0C843 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00032P0C843 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00032P0C843 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00032P0C843 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00032P0C843 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00032P0C843 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00032P0C843 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00032P0C843 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00032P0C843 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00032P0C843 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00032P0C843 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00032P0C843 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00032P0C843 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00032P0C843 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00032P0C843 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00032P0C843 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00032P0C843 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00032P0C843 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00032P0C843 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00032P0C843 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00032P0C843 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00032P0C843 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00032P0C843 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00032P0C843 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00032P0C843 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC16■□□□□ 0.15
LINC00032P0C843 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00032P0C843 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00032P0C843 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00032P0C843 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC16■□□□□ 0.15
LINC00032P0C843 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00032P0C843 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00032P0C843 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00032P0C843 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00032P0C843 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00032P0C843 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00032P0C843 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00032P0C843 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00032P0C843 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00032P0C843 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00032P0C843 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00032P0C843 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00032P0C843 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC16■□□□□ 0.15
LINC00032P0C843 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00032P0C843 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC16■□□□□ 0.15
LINC00032P0C843 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC16■□□□□ 0.15
LINC00032P0C843 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00032P0C843 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00032P0C843 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00032P0C843 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00032P0C843 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00032P0C843 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00032P0C843 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00032P0C843 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00032P0C843 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00032P0C843 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00032P0C843 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC16■□□□□ 0.15
LINC00032P0C843 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00032P0C843 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00032P0C843 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00032P0C843 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00032P0C843 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00032P0C843 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00032P0C843 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00032P0C843 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00032P0C843 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00032P0C843 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00032P0C843 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00032P0C843 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00032P0C843 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00032P0C843 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00032P0C843 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00032P0C843 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00032P0C843 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 310.9 ms