Protein–RNA interactions for Protein: P08240

SRPRA, Signal recognition particle receptor subunit alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 638 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPRAP08240 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SRPRAP08240 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SRPRAP08240 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SRPRAP08240 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SRPRAP08240 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SRPRAP08240 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SRPRAP08240 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SRPRAP08240 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SRPRAP08240 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SRPRAP08240 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SRPRAP08240 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SRPRAP08240 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SRPRAP08240 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SRPRAP08240 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SRPRAP08240 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SRPRAP08240 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SRPRAP08240 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SRPRAP08240 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SRPRAP08240 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SRPRAP08240 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SRPRAP08240 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SRPRAP08240 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SRPRAP08240 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SRPRAP08240 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SRPRAP08240 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SRPRAP08240 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SRPRAP08240 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SRPRAP08240 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SRPRAP08240 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SRPRAP08240 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SRPRAP08240 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SRPRAP08240 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SRPRAP08240 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SRPRAP08240 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SRPRAP08240 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SRPRAP08240 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SRPRAP08240 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SRPRAP08240 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SRPRAP08240 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SRPRAP08240 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SRPRAP08240 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SRPRAP08240 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SRPRAP08240 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SRPRAP08240 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SRPRAP08240 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SRPRAP08240 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SRPRAP08240 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SRPRAP08240 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SRPRAP08240 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SRPRAP08240 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SRPRAP08240 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SRPRAP08240 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SRPRAP08240 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SRPRAP08240 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SRPRAP08240 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SRPRAP08240 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SRPRAP08240 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SRPRAP08240 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SRPRAP08240 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SRPRAP08240 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SRPRAP08240 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SRPRAP08240 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SRPRAP08240 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SRPRAP08240 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SRPRAP08240 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SRPRAP08240 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SRPRAP08240 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SRPRAP08240 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SRPRAP08240 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SRPRAP08240 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SRPRAP08240 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SRPRAP08240 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SRPRAP08240 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SRPRAP08240 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SRPRAP08240 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SRPRAP08240 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SRPRAP08240 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SRPRAP08240 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SRPRAP08240 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SRPRAP08240 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SRPRAP08240 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SRPRAP08240 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SRPRAP08240 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SRPRAP08240 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SRPRAP08240 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SRPRAP08240 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SRPRAP08240 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SRPRAP08240 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SRPRAP08240 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SRPRAP08240 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SRPRAP08240 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SRPRAP08240 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SRPRAP08240 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SRPRAP08240 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SRPRAP08240 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SRPRAP08240 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SRPRAP08240 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SRPRAP08240 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SRPRAP08240 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SRPRAP08240 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
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