Protein–RNA interactions for Protein: P05107

ITGB2, Integrin beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 769 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB2P05107 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGB2P05107 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGB2P05107 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGB2P05107 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGB2P05107 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGB2P05107 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGB2P05107 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGB2P05107 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGB2P05107 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGB2P05107 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGB2P05107 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGB2P05107 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGB2P05107 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGB2P05107 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGB2P05107 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGB2P05107 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGB2P05107 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGB2P05107 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGB2P05107 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGB2P05107 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGB2P05107 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGB2P05107 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGB2P05107 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGB2P05107 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGB2P05107 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGB2P05107 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGB2P05107 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGB2P05107 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGB2P05107 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGB2P05107 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGB2P05107 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGB2P05107 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGB2P05107 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGB2P05107 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGB2P05107 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGB2P05107 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGB2P05107 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGB2P05107 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGB2P05107 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGB2P05107 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGB2P05107 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGB2P05107 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGB2P05107 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGB2P05107 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGB2P05107 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGB2P05107 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGB2P05107 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGB2P05107 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGB2P05107 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGB2P05107 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGB2P05107 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGB2P05107 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGB2P05107 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGB2P05107 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGB2P05107 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGB2P05107 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGB2P05107 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGB2P05107 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGB2P05107 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGB2P05107 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGB2P05107 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGB2P05107 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGB2P05107 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGB2P05107 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGB2P05107 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGB2P05107 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGB2P05107 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGB2P05107 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGB2P05107 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGB2P05107 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGB2P05107 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGB2P05107 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGB2P05107 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGB2P05107 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGB2P05107 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGB2P05107 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGB2P05107 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGB2P05107 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGB2P05107 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGB2P05107 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGB2P05107 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGB2P05107 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGB2P05107 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGB2P05107 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGB2P05107 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGB2P05107 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGB2P05107 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGB2P05107 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGB2P05107 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGB2P05107 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGB2P05107 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGB2P05107 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGB2P05107 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGB2P05107 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGB2P05107 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGB2P05107 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGB2P05107 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGB2P05107 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGB2P05107 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGB2P05107 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms