Protein–RNA interactions for Protein: O95931

CBX7, Chromobox protein homolog 7, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX7O95931 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CBX7O95931 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CBX7O95931 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CBX7O95931 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CBX7O95931 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CBX7O95931 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CBX7O95931 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CBX7O95931 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CBX7O95931 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CBX7O95931 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CBX7O95931 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CBX7O95931 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CBX7O95931 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CBX7O95931 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CBX7O95931 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CBX7O95931 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CBX7O95931 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CBX7O95931 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CBX7O95931 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CBX7O95931 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CBX7O95931 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CBX7O95931 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CBX7O95931 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CBX7O95931 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CBX7O95931 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CBX7O95931 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CBX7O95931 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CBX7O95931 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CBX7O95931 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CBX7O95931 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CBX7O95931 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CBX7O95931 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CBX7O95931 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CBX7O95931 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CBX7O95931 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CBX7O95931 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CBX7O95931 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CBX7O95931 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CBX7O95931 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CBX7O95931 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CBX7O95931 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CBX7O95931 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CBX7O95931 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CBX7O95931 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CBX7O95931 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CBX7O95931 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CBX7O95931 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CBX7O95931 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CBX7O95931 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CBX7O95931 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CBX7O95931 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CBX7O95931 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CBX7O95931 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CBX7O95931 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CBX7O95931 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CBX7O95931 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CBX7O95931 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CBX7O95931 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CBX7O95931 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CBX7O95931 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CBX7O95931 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CBX7O95931 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CBX7O95931 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CBX7O95931 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CBX7O95931 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CBX7O95931 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CBX7O95931 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CBX7O95931 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CBX7O95931 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CBX7O95931 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CBX7O95931 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CBX7O95931 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CBX7O95931 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CBX7O95931 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CBX7O95931 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CBX7O95931 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CBX7O95931 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CBX7O95931 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CBX7O95931 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CBX7O95931 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CBX7O95931 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CBX7O95931 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CBX7O95931 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CBX7O95931 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CBX7O95931 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CBX7O95931 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CBX7O95931 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CBX7O95931 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CBX7O95931 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CBX7O95931 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CBX7O95931 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CBX7O95931 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CBX7O95931 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CBX7O95931 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CBX7O95931 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CBX7O95931 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CBX7O95931 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CBX7O95931 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CBX7O95931 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CBX7O95931 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.8 ms