Protein–RNA interactions for Protein: O95873

C6orf47, Uncharacterized protein C6orf47, humanhuman

Predictions only

Length 294 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf47O95873 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C6orf47O95873 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C6orf47O95873 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C6orf47O95873 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C6orf47O95873 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C6orf47O95873 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C6orf47O95873 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C6orf47O95873 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C6orf47O95873 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C6orf47O95873 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C6orf47O95873 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C6orf47O95873 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C6orf47O95873 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C6orf47O95873 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C6orf47O95873 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C6orf47O95873 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
C6orf47O95873 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C6orf47O95873 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C6orf47O95873 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
C6orf47O95873 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C6orf47O95873 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C6orf47O95873 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C6orf47O95873 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C6orf47O95873 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C6orf47O95873 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C6orf47O95873 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C6orf47O95873 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C6orf47O95873 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C6orf47O95873 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
C6orf47O95873 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C6orf47O95873 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C6orf47O95873 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C6orf47O95873 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C6orf47O95873 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C6orf47O95873 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C6orf47O95873 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C6orf47O95873 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C6orf47O95873 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C6orf47O95873 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C6orf47O95873 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C6orf47O95873 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C6orf47O95873 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C6orf47O95873 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C6orf47O95873 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C6orf47O95873 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C6orf47O95873 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C6orf47O95873 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C6orf47O95873 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C6orf47O95873 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
C6orf47O95873 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
C6orf47O95873 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
C6orf47O95873 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
C6orf47O95873 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
C6orf47O95873 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
C6orf47O95873 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
C6orf47O95873 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C6orf47O95873 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C6orf47O95873 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C6orf47O95873 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C6orf47O95873 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C6orf47O95873 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
C6orf47O95873 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C6orf47O95873 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C6orf47O95873 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C6orf47O95873 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C6orf47O95873 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C6orf47O95873 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
C6orf47O95873 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C6orf47O95873 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C6orf47O95873 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C6orf47O95873 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
C6orf47O95873 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C6orf47O95873 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C6orf47O95873 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C6orf47O95873 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
C6orf47O95873 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C6orf47O95873 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C6orf47O95873 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C6orf47O95873 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C6orf47O95873 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C6orf47O95873 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C6orf47O95873 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C6orf47O95873 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C6orf47O95873 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C6orf47O95873 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C6orf47O95873 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C6orf47O95873 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C6orf47O95873 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C6orf47O95873 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C6orf47O95873 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C6orf47O95873 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C6orf47O95873 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C6orf47O95873 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C6orf47O95873 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C6orf47O95873 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C6orf47O95873 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C6orf47O95873 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C6orf47O95873 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C6orf47O95873 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C6orf47O95873 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms