Protein–RNA interactions for Protein: O75578

ITGA10, Integrin alpha-10, humanhuman

Predictions only

Length 1,167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA10O75578 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGA10O75578 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGA10O75578 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGA10O75578 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGA10O75578 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGA10O75578 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGA10O75578 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGA10O75578 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGA10O75578 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGA10O75578 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGA10O75578 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGA10O75578 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGA10O75578 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGA10O75578 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGA10O75578 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGA10O75578 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGA10O75578 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGA10O75578 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGA10O75578 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGA10O75578 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGA10O75578 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGA10O75578 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGA10O75578 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGA10O75578 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGA10O75578 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGA10O75578 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGA10O75578 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGA10O75578 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGA10O75578 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGA10O75578 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGA10O75578 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGA10O75578 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGA10O75578 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGA10O75578 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGA10O75578 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGA10O75578 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGA10O75578 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGA10O75578 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGA10O75578 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGA10O75578 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGA10O75578 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGA10O75578 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGA10O75578 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGA10O75578 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGA10O75578 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGA10O75578 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGA10O75578 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGA10O75578 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGA10O75578 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGA10O75578 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGA10O75578 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGA10O75578 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGA10O75578 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGA10O75578 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGA10O75578 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGA10O75578 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGA10O75578 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGA10O75578 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGA10O75578 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGA10O75578 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGA10O75578 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGA10O75578 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGA10O75578 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGA10O75578 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGA10O75578 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGA10O75578 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGA10O75578 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGA10O75578 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGA10O75578 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGA10O75578 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGA10O75578 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGA10O75578 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGA10O75578 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGA10O75578 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGA10O75578 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGA10O75578 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGA10O75578 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGA10O75578 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGA10O75578 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGA10O75578 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGA10O75578 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGA10O75578 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGA10O75578 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGA10O75578 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGA10O75578 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGA10O75578 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGA10O75578 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGA10O75578 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGA10O75578 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGA10O75578 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGA10O75578 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGA10O75578 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGA10O75578 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGA10O75578 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGA10O75578 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGA10O75578 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGA10O75578 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGA10O75578 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGA10O75578 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGA10O75578 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms