Protein–RNA interactions for Protein: O60811

PRAMEF2, PRAME family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF2O60811 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRAMEF2O60811 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PRAMEF2O60811 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PRAMEF2O60811 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRAMEF2O60811 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PRAMEF2O60811 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PRAMEF2O60811 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRAMEF2O60811 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRAMEF2O60811 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRAMEF2O60811 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRAMEF2O60811 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRAMEF2O60811 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRAMEF2O60811 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRAMEF2O60811 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRAMEF2O60811 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRAMEF2O60811 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRAMEF2O60811 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRAMEF2O60811 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PRAMEF2O60811 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRAMEF2O60811 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRAMEF2O60811 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRAMEF2O60811 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRAMEF2O60811 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PRAMEF2O60811 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRAMEF2O60811 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRAMEF2O60811 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRAMEF2O60811 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PRAMEF2O60811 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRAMEF2O60811 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRAMEF2O60811 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRAMEF2O60811 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRAMEF2O60811 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRAMEF2O60811 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRAMEF2O60811 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PRAMEF2O60811 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRAMEF2O60811 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRAMEF2O60811 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRAMEF2O60811 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRAMEF2O60811 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRAMEF2O60811 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRAMEF2O60811 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRAMEF2O60811 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRAMEF2O60811 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRAMEF2O60811 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRAMEF2O60811 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRAMEF2O60811 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PRAMEF2O60811 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRAMEF2O60811 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRAMEF2O60811 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRAMEF2O60811 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRAMEF2O60811 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PRAMEF2O60811 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRAMEF2O60811 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRAMEF2O60811 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRAMEF2O60811 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PRAMEF2O60811 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRAMEF2O60811 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRAMEF2O60811 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRAMEF2O60811 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRAMEF2O60811 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRAMEF2O60811 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRAMEF2O60811 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRAMEF2O60811 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRAMEF2O60811 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRAMEF2O60811 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRAMEF2O60811 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRAMEF2O60811 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRAMEF2O60811 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRAMEF2O60811 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRAMEF2O60811 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRAMEF2O60811 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRAMEF2O60811 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRAMEF2O60811 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRAMEF2O60811 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRAMEF2O60811 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRAMEF2O60811 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRAMEF2O60811 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRAMEF2O60811 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRAMEF2O60811 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRAMEF2O60811 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRAMEF2O60811 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRAMEF2O60811 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRAMEF2O60811 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRAMEF2O60811 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRAMEF2O60811 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRAMEF2O60811 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRAMEF2O60811 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRAMEF2O60811 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRAMEF2O60811 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRAMEF2O60811 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRAMEF2O60811 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRAMEF2O60811 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRAMEF2O60811 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRAMEF2O60811 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PRAMEF2O60811 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRAMEF2O60811 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRAMEF2O60811 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRAMEF2O60811 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRAMEF2O60811 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRAMEF2O60811 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms