Protein–RNA interactions for Protein: O60437

PPL, Periplakin, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPLO60437 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PPLO60437 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PPLO60437 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PPLO60437 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PPLO60437 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PPLO60437 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PPLO60437 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PPLO60437 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PPLO60437 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PPLO60437 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PPLO60437 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PPLO60437 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PPLO60437 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PPLO60437 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PPLO60437 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PPLO60437 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PPLO60437 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PPLO60437 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PPLO60437 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PPLO60437 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PPLO60437 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PPLO60437 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PPLO60437 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PPLO60437 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PPLO60437 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PPLO60437 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PPLO60437 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PPLO60437 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PPLO60437 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PPLO60437 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PPLO60437 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PPLO60437 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PPLO60437 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PPLO60437 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PPLO60437 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PPLO60437 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PPLO60437 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PPLO60437 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PPLO60437 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PPLO60437 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PPLO60437 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPLO60437 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPLO60437 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPLO60437 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPLO60437 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPLO60437 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPLO60437 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPLO60437 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPLO60437 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPLO60437 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPLO60437 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPLO60437 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPLO60437 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPLO60437 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPLO60437 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPLO60437 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPLO60437 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPLO60437 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPLO60437 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPLO60437 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPLO60437 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPLO60437 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPLO60437 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPLO60437 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPLO60437 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPLO60437 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPLO60437 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PPLO60437 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPLO60437 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PPLO60437 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PPLO60437 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPLO60437 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPLO60437 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPLO60437 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPLO60437 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPLO60437 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPLO60437 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPLO60437 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PPLO60437 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPLO60437 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPLO60437 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPLO60437 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPLO60437 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPLO60437 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPLO60437 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PPLO60437 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPLO60437 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPLO60437 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PPLO60437 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPLO60437 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPLO60437 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPLO60437 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPLO60437 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPLO60437 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPLO60437 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPLO60437 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPLO60437 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPLO60437 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPLO60437 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPLO60437 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms