Protein–RNA interactions for Protein: O43248

HOXC11, Homeobox protein Hox-C11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC11O43248 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXC11O43248 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXC11O43248 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXC11O43248 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXC11O43248 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXC11O43248 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXC11O43248 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXC11O43248 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXC11O43248 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXC11O43248 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXC11O43248 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXC11O43248 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXC11O43248 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXC11O43248 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXC11O43248 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXC11O43248 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXC11O43248 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXC11O43248 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXC11O43248 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXC11O43248 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXC11O43248 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXC11O43248 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXC11O43248 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXC11O43248 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXC11O43248 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXC11O43248 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXC11O43248 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXC11O43248 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXC11O43248 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXC11O43248 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXC11O43248 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXC11O43248 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXC11O43248 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXC11O43248 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXC11O43248 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXC11O43248 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXC11O43248 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXC11O43248 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXC11O43248 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXC11O43248 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXC11O43248 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXC11O43248 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXC11O43248 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXC11O43248 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXC11O43248 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXC11O43248 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXC11O43248 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXC11O43248 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXC11O43248 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXC11O43248 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXC11O43248 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXC11O43248 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXC11O43248 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXC11O43248 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXC11O43248 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXC11O43248 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXC11O43248 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXC11O43248 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXC11O43248 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXC11O43248 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXC11O43248 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXC11O43248 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXC11O43248 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXC11O43248 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXC11O43248 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXC11O43248 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXC11O43248 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXC11O43248 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXC11O43248 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXC11O43248 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXC11O43248 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXC11O43248 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXC11O43248 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXC11O43248 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXC11O43248 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXC11O43248 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXC11O43248 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXC11O43248 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXC11O43248 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXC11O43248 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXC11O43248 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXC11O43248 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXC11O43248 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXC11O43248 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXC11O43248 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXC11O43248 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXC11O43248 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXC11O43248 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXC11O43248 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXC11O43248 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXC11O43248 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXC11O43248 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXC11O43248 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXC11O43248 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXC11O43248 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXC11O43248 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXC11O43248 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXC11O43248 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HOXC11O43248 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HOXC11O43248 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms