Protein–RNA interactions for Protein: B4DGG1

cDNA FLJ60496, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DGG1 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
B4DGG1 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
B4DGG1 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
B4DGG1 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
B4DGG1 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
B4DGG1 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
B4DGG1 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
B4DGG1 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
B4DGG1 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
B4DGG1 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
B4DGG1 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
B4DGG1 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
B4DGG1 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
B4DGG1 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
B4DGG1 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
B4DGG1 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
B4DGG1 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
B4DGG1 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
B4DGG1 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
B4DGG1 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
B4DGG1 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
B4DGG1 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
B4DGG1 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
B4DGG1 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
B4DGG1 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
B4DGG1 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
B4DGG1 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
B4DGG1 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
B4DGG1 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
B4DGG1 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
B4DGG1 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
B4DGG1 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
B4DGG1 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
B4DGG1 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
B4DGG1 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
B4DGG1 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
B4DGG1 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
B4DGG1 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
B4DGG1 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
B4DGG1 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
B4DGG1 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
B4DGG1 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
B4DGG1 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
B4DGG1 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
B4DGG1 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
B4DGG1 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
B4DGG1 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
B4DGG1 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
B4DGG1 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
B4DGG1 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
B4DGG1 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
B4DGG1 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
B4DGG1 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
B4DGG1 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
B4DGG1 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
B4DGG1 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
B4DGG1 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
B4DGG1 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
B4DGG1 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
B4DGG1 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
B4DGG1 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
B4DGG1 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
B4DGG1 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
B4DGG1 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
B4DGG1 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
B4DGG1 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
B4DGG1 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
B4DGG1 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
B4DGG1 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
B4DGG1 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
B4DGG1 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
B4DGG1 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
B4DGG1 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
B4DGG1 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
B4DGG1 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
B4DGG1 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
B4DGG1 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
B4DGG1 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
B4DGG1 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
B4DGG1 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
B4DGG1 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
B4DGG1 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
B4DGG1 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
B4DGG1 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
B4DGG1 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
B4DGG1 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
B4DGG1 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
B4DGG1 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
B4DGG1 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
B4DGG1 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
B4DGG1 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
B4DGG1 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
B4DGG1 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
B4DGG1 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
B4DGG1 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
B4DGG1 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
B4DGG1 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
B4DGG1 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
B4DGG1 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
B4DGG1 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms