Protein–RNA interactions for Protein: B2RD01

CENPBD1, CENPB DNA-binding domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPBD1B2RD01 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CENPBD1B2RD01 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CENPBD1B2RD01 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CENPBD1B2RD01 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CENPBD1B2RD01 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CENPBD1B2RD01 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CENPBD1B2RD01 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CENPBD1B2RD01 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CENPBD1B2RD01 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CENPBD1B2RD01 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CENPBD1B2RD01 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CENPBD1B2RD01 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CENPBD1B2RD01 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CENPBD1B2RD01 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CENPBD1B2RD01 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CENPBD1B2RD01 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CENPBD1B2RD01 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CENPBD1B2RD01 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CENPBD1B2RD01 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CENPBD1B2RD01 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CENPBD1B2RD01 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CENPBD1B2RD01 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CENPBD1B2RD01 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CENPBD1B2RD01 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CENPBD1B2RD01 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CENPBD1B2RD01 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CENPBD1B2RD01 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CENPBD1B2RD01 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CENPBD1B2RD01 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CENPBD1B2RD01 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CENPBD1B2RD01 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CENPBD1B2RD01 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CENPBD1B2RD01 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CENPBD1B2RD01 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CENPBD1B2RD01 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CENPBD1B2RD01 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CENPBD1B2RD01 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CENPBD1B2RD01 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CENPBD1B2RD01 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CENPBD1B2RD01 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CENPBD1B2RD01 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CENPBD1B2RD01 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CENPBD1B2RD01 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CENPBD1B2RD01 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CENPBD1B2RD01 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CENPBD1B2RD01 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CENPBD1B2RD01 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CENPBD1B2RD01 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CENPBD1B2RD01 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CENPBD1B2RD01 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CENPBD1B2RD01 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CENPBD1B2RD01 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CENPBD1B2RD01 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CENPBD1B2RD01 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CENPBD1B2RD01 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CENPBD1B2RD01 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CENPBD1B2RD01 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CENPBD1B2RD01 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CENPBD1B2RD01 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CENPBD1B2RD01 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CENPBD1B2RD01 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CENPBD1B2RD01 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CENPBD1B2RD01 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CENPBD1B2RD01 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CENPBD1B2RD01 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CENPBD1B2RD01 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CENPBD1B2RD01 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CENPBD1B2RD01 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CENPBD1B2RD01 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CENPBD1B2RD01 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CENPBD1B2RD01 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CENPBD1B2RD01 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CENPBD1B2RD01 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CENPBD1B2RD01 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CENPBD1B2RD01 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CENPBD1B2RD01 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CENPBD1B2RD01 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CENPBD1B2RD01 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CENPBD1B2RD01 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CENPBD1B2RD01 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CENPBD1B2RD01 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CENPBD1B2RD01 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CENPBD1B2RD01 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CENPBD1B2RD01 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CENPBD1B2RD01 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
CENPBD1B2RD01 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CENPBD1B2RD01 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CENPBD1B2RD01 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CENPBD1B2RD01 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CENPBD1B2RD01 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CENPBD1B2RD01 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CENPBD1B2RD01 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CENPBD1B2RD01 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CENPBD1B2RD01 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CENPBD1B2RD01 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CENPBD1B2RD01 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CENPBD1B2RD01 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CENPBD1B2RD01 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CENPBD1B2RD01 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CENPBD1B2RD01 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms