Protein–RNA interactions for Protein: A2IDD5

CCDC78, Coiled-coil domain-containing protein 78, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC78A2IDD5 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC78A2IDD5 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC78A2IDD5 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC78A2IDD5 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC78A2IDD5 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC78A2IDD5 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC78A2IDD5 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC78A2IDD5 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC78A2IDD5 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC78A2IDD5 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC78A2IDD5 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC78A2IDD5 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC78A2IDD5 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC78A2IDD5 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC78A2IDD5 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC78A2IDD5 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC78A2IDD5 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC78A2IDD5 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC78A2IDD5 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC78A2IDD5 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC78A2IDD5 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC78A2IDD5 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC78A2IDD5 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC78A2IDD5 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC78A2IDD5 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC78A2IDD5 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC78A2IDD5 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC78A2IDD5 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC78A2IDD5 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC78A2IDD5 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC78A2IDD5 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC78A2IDD5 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC78A2IDD5 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC78A2IDD5 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC78A2IDD5 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC78A2IDD5 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC78A2IDD5 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC78A2IDD5 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC78A2IDD5 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC78A2IDD5 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC78A2IDD5 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC78A2IDD5 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC78A2IDD5 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC78A2IDD5 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC78A2IDD5 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC78A2IDD5 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC78A2IDD5 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC78A2IDD5 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC78A2IDD5 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC78A2IDD5 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC78A2IDD5 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC78A2IDD5 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC78A2IDD5 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC78A2IDD5 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC78A2IDD5 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC78A2IDD5 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC78A2IDD5 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC78A2IDD5 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC78A2IDD5 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC78A2IDD5 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC78A2IDD5 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC78A2IDD5 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC78A2IDD5 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC78A2IDD5 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC78A2IDD5 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC78A2IDD5 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC78A2IDD5 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC78A2IDD5 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC78A2IDD5 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC78A2IDD5 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC78A2IDD5 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC78A2IDD5 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC78A2IDD5 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC78A2IDD5 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC78A2IDD5 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC78A2IDD5 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC78A2IDD5 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC78A2IDD5 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC78A2IDD5 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC78A2IDD5 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC78A2IDD5 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC78A2IDD5 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC78A2IDD5 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC78A2IDD5 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC78A2IDD5 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC78A2IDD5 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC78A2IDD5 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC78A2IDD5 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC78A2IDD5 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC78A2IDD5 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC78A2IDD5 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC78A2IDD5 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC78A2IDD5 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC78A2IDD5 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC78A2IDD5 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC78A2IDD5 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC78A2IDD5 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC78A2IDD5 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC78A2IDD5 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC78A2IDD5 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms