Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y366

IFT52, Intraflagellar transport protein 52 homolog, humanhuman

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Length 437 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT52Q9Y366 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IFT52Q9Y366 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IFT52Q9Y366 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
IFT52Q9Y366 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IFT52Q9Y366 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IFT52Q9Y366 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IFT52Q9Y366 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IFT52Q9Y366 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IFT52Q9Y366 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IFT52Q9Y366 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IFT52Q9Y366 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IFT52Q9Y366 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IFT52Q9Y366 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IFT52Q9Y366 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IFT52Q9Y366 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IFT52Q9Y366 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
IFT52Q9Y366 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IFT52Q9Y366 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IFT52Q9Y366 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IFT52Q9Y366 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IFT52Q9Y366 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IFT52Q9Y366 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IFT52Q9Y366 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IFT52Q9Y366 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IFT52Q9Y366 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IFT52Q9Y366 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IFT52Q9Y366 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IFT52Q9Y366 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IFT52Q9Y366 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
IFT52Q9Y366 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IFT52Q9Y366 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IFT52Q9Y366 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IFT52Q9Y366 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
IFT52Q9Y366 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IFT52Q9Y366 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IFT52Q9Y366 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IFT52Q9Y366 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
IFT52Q9Y366 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IFT52Q9Y366 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IFT52Q9Y366 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IFT52Q9Y366 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IFT52Q9Y366 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IFT52Q9Y366 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IFT52Q9Y366 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IFT52Q9Y366 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IFT52Q9Y366 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IFT52Q9Y366 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IFT52Q9Y366 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IFT52Q9Y366 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IFT52Q9Y366 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IFT52Q9Y366 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IFT52Q9Y366 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IFT52Q9Y366 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IFT52Q9Y366 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IFT52Q9Y366 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFT52Q9Y366 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFT52Q9Y366 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFT52Q9Y366 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFT52Q9Y366 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFT52Q9Y366 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFT52Q9Y366 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFT52Q9Y366 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFT52Q9Y366 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFT52Q9Y366 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFT52Q9Y366 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFT52Q9Y366 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFT52Q9Y366 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFT52Q9Y366 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFT52Q9Y366 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFT52Q9Y366 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFT52Q9Y366 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
IFT52Q9Y366 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFT52Q9Y366 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFT52Q9Y366 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFT52Q9Y366 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFT52Q9Y366 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFT52Q9Y366 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFT52Q9Y366 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFT52Q9Y366 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFT52Q9Y366 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
IFT52Q9Y366 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
IFT52Q9Y366 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFT52Q9Y366 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFT52Q9Y366 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFT52Q9Y366 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
IFT52Q9Y366 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFT52Q9Y366 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFT52Q9Y366 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFT52Q9Y366 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFT52Q9Y366 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFT52Q9Y366 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFT52Q9Y366 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFT52Q9Y366 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFT52Q9Y366 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFT52Q9Y366 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFT52Q9Y366 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFT52Q9Y366 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFT52Q9Y366 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFT52Q9Y366 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFT52Q9Y366 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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