Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2E8

SLC9A8, Sodium/hydrogen exchanger 8, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A8Q9Y2E8 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC9A8Q9Y2E8 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC9A8Q9Y2E8 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC9A8Q9Y2E8 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC9A8Q9Y2E8 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SLC9A8Q9Y2E8 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SLC9A8Q9Y2E8 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SLC9A8Q9Y2E8 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SLC9A8Q9Y2E8 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SLC9A8Q9Y2E8 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SLC9A8Q9Y2E8 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SLC9A8Q9Y2E8 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SLC9A8Q9Y2E8 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SLC9A8Q9Y2E8 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
SLC9A8Q9Y2E8 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC9A8Q9Y2E8 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC9A8Q9Y2E8 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC9A8Q9Y2E8 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC9A8Q9Y2E8 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC9A8Q9Y2E8 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC9A8Q9Y2E8 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC9A8Q9Y2E8 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC9A8Q9Y2E8 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC9A8Q9Y2E8 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC9A8Q9Y2E8 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC9A8Q9Y2E8 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC9A8Q9Y2E8 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC9A8Q9Y2E8 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC9A8Q9Y2E8 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC9A8Q9Y2E8 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC9A8Q9Y2E8 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC9A8Q9Y2E8 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC9A8Q9Y2E8 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC9A8Q9Y2E8 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC9A8Q9Y2E8 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC9A8Q9Y2E8 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC9A8Q9Y2E8 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC9A8Q9Y2E8 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC9A8Q9Y2E8 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC9A8Q9Y2E8 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC9A8Q9Y2E8 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC9A8Q9Y2E8 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC9A8Q9Y2E8 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC9A8Q9Y2E8 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC9A8Q9Y2E8 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC9A8Q9Y2E8 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC9A8Q9Y2E8 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC9A8Q9Y2E8 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC9A8Q9Y2E8 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC9A8Q9Y2E8 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC9A8Q9Y2E8 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC9A8Q9Y2E8 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC9A8Q9Y2E8 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC9A8Q9Y2E8 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC9A8Q9Y2E8 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC9A8Q9Y2E8 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC9A8Q9Y2E8 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC9A8Q9Y2E8 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC9A8Q9Y2E8 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC9A8Q9Y2E8 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC9A8Q9Y2E8 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC9A8Q9Y2E8 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC9A8Q9Y2E8 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC9A8Q9Y2E8 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC9A8Q9Y2E8 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC9A8Q9Y2E8 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC9A8Q9Y2E8 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC9A8Q9Y2E8 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC9A8Q9Y2E8 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC9A8Q9Y2E8 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC9A8Q9Y2E8 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC9A8Q9Y2E8 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC9A8Q9Y2E8 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC9A8Q9Y2E8 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC9A8Q9Y2E8 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC9A8Q9Y2E8 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC9A8Q9Y2E8 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC9A8Q9Y2E8 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC9A8Q9Y2E8 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC9A8Q9Y2E8 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC9A8Q9Y2E8 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC9A8Q9Y2E8 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC9A8Q9Y2E8 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC9A8Q9Y2E8 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC9A8Q9Y2E8 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC9A8Q9Y2E8 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC9A8Q9Y2E8 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC9A8Q9Y2E8 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC9A8Q9Y2E8 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC9A8Q9Y2E8 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC9A8Q9Y2E8 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC9A8Q9Y2E8 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC9A8Q9Y2E8 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC9A8Q9Y2E8 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC9A8Q9Y2E8 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC9A8Q9Y2E8 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC9A8Q9Y2E8 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC9A8Q9Y2E8 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC9A8Q9Y2E8 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC9A8Q9Y2E8 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.8 ms