Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNS2

COPS3, COP9 signalosome complex subunit 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS3Q9UNS2 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
COPS3Q9UNS2 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
COPS3Q9UNS2 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
COPS3Q9UNS2 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
COPS3Q9UNS2 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
COPS3Q9UNS2 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
COPS3Q9UNS2 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
COPS3Q9UNS2 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
COPS3Q9UNS2 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
COPS3Q9UNS2 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
COPS3Q9UNS2 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
COPS3Q9UNS2 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
COPS3Q9UNS2 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
COPS3Q9UNS2 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
COPS3Q9UNS2 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
COPS3Q9UNS2 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
COPS3Q9UNS2 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
COPS3Q9UNS2 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
COPS3Q9UNS2 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
COPS3Q9UNS2 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
COPS3Q9UNS2 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
COPS3Q9UNS2 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
COPS3Q9UNS2 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
COPS3Q9UNS2 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
COPS3Q9UNS2 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
COPS3Q9UNS2 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
COPS3Q9UNS2 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
COPS3Q9UNS2 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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COPS3Q9UNS2 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
COPS3Q9UNS2 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
COPS3Q9UNS2 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
COPS3Q9UNS2 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
COPS3Q9UNS2 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
COPS3Q9UNS2 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
COPS3Q9UNS2 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
COPS3Q9UNS2 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
COPS3Q9UNS2 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
COPS3Q9UNS2 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
COPS3Q9UNS2 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
COPS3Q9UNS2 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
COPS3Q9UNS2 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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COPS3Q9UNS2 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
COPS3Q9UNS2 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
COPS3Q9UNS2 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
COPS3Q9UNS2 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
COPS3Q9UNS2 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
COPS3Q9UNS2 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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COPS3Q9UNS2 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
COPS3Q9UNS2 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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COPS3Q9UNS2 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
COPS3Q9UNS2 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
COPS3Q9UNS2 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
COPS3Q9UNS2 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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COPS3Q9UNS2 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
COPS3Q9UNS2 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
COPS3Q9UNS2 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
COPS3Q9UNS2 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
COPS3Q9UNS2 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
COPS3Q9UNS2 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
COPS3Q9UNS2 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
COPS3Q9UNS2 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
COPS3Q9UNS2 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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COPS3Q9UNS2 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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COPS3Q9UNS2 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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COPS3Q9UNS2 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
COPS3Q9UNS2 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
COPS3Q9UNS2 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
COPS3Q9UNS2 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
COPS3Q9UNS2 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
COPS3Q9UNS2 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
COPS3Q9UNS2 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
COPS3Q9UNS2 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
COPS3Q9UNS2 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
COPS3Q9UNS2 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
COPS3Q9UNS2 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
COPS3Q9UNS2 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
COPS3Q9UNS2 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
COPS3Q9UNS2 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
COPS3Q9UNS2 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
COPS3Q9UNS2 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
COPS3Q9UNS2 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
COPS3Q9UNS2 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
COPS3Q9UNS2 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
COPS3Q9UNS2 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
COPS3Q9UNS2 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
COPS3Q9UNS2 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
COPS3Q9UNS2 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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