Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX36

DNAJC28, DnaJ homolog subfamily C member 28, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJC28Q9NX36 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DNAJC28Q9NX36 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DNAJC28Q9NX36 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DNAJC28Q9NX36 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DNAJC28Q9NX36 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DNAJC28Q9NX36 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DNAJC28Q9NX36 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DNAJC28Q9NX36 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
DNAJC28Q9NX36 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DNAJC28Q9NX36 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DNAJC28Q9NX36 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DNAJC28Q9NX36 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DNAJC28Q9NX36 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DNAJC28Q9NX36 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DNAJC28Q9NX36 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DNAJC28Q9NX36 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DNAJC28Q9NX36 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
DNAJC28Q9NX36 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DNAJC28Q9NX36 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DNAJC28Q9NX36 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DNAJC28Q9NX36 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DNAJC28Q9NX36 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DNAJC28Q9NX36 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DNAJC28Q9NX36 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DNAJC28Q9NX36 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DNAJC28Q9NX36 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DNAJC28Q9NX36 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DNAJC28Q9NX36 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DNAJC28Q9NX36 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DNAJC28Q9NX36 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DNAJC28Q9NX36 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DNAJC28Q9NX36 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DNAJC28Q9NX36 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DNAJC28Q9NX36 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
DNAJC28Q9NX36 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DNAJC28Q9NX36 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DNAJC28Q9NX36 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
DNAJC28Q9NX36 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DNAJC28Q9NX36 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DNAJC28Q9NX36 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
DNAJC28Q9NX36 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
DNAJC28Q9NX36 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DNAJC28Q9NX36 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
DNAJC28Q9NX36 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DNAJC28Q9NX36 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DNAJC28Q9NX36 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DNAJC28Q9NX36 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DNAJC28Q9NX36 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DNAJC28Q9NX36 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DNAJC28Q9NX36 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DNAJC28Q9NX36 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DNAJC28Q9NX36 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DNAJC28Q9NX36 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DNAJC28Q9NX36 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DNAJC28Q9NX36 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DNAJC28Q9NX36 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DNAJC28Q9NX36 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
DNAJC28Q9NX36 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DNAJC28Q9NX36 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DNAJC28Q9NX36 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DNAJC28Q9NX36 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DNAJC28Q9NX36 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DNAJC28Q9NX36 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DNAJC28Q9NX36 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DNAJC28Q9NX36 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DNAJC28Q9NX36 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DNAJC28Q9NX36 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DNAJC28Q9NX36 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DNAJC28Q9NX36 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
DNAJC28Q9NX36 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DNAJC28Q9NX36 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DNAJC28Q9NX36 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DNAJC28Q9NX36 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DNAJC28Q9NX36 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DNAJC28Q9NX36 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DNAJC28Q9NX36 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DNAJC28Q9NX36 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DNAJC28Q9NX36 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DNAJC28Q9NX36 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DNAJC28Q9NX36 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DNAJC28Q9NX36 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DNAJC28Q9NX36 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DNAJC28Q9NX36 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
DNAJC28Q9NX36 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DNAJC28Q9NX36 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DNAJC28Q9NX36 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DNAJC28Q9NX36 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DNAJC28Q9NX36 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DNAJC28Q9NX36 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DNAJC28Q9NX36 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DNAJC28Q9NX36 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DNAJC28Q9NX36 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DNAJC28Q9NX36 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DNAJC28Q9NX36 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DNAJC28Q9NX36 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DNAJC28Q9NX36 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DNAJC28Q9NX36 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
DNAJC28Q9NX36 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DNAJC28Q9NX36 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DNAJC28Q9NX36 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms