Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSU2

TREX1, Three-prime repair exonuclease 1, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREX1Q9NSU2 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TREX1Q9NSU2 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TREX1Q9NSU2 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TREX1Q9NSU2 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TREX1Q9NSU2 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TREX1Q9NSU2 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TREX1Q9NSU2 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TREX1Q9NSU2 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TREX1Q9NSU2 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TREX1Q9NSU2 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TREX1Q9NSU2 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TREX1Q9NSU2 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TREX1Q9NSU2 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TREX1Q9NSU2 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TREX1Q9NSU2 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TREX1Q9NSU2 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TREX1Q9NSU2 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TREX1Q9NSU2 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TREX1Q9NSU2 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TREX1Q9NSU2 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TREX1Q9NSU2 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TREX1Q9NSU2 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TREX1Q9NSU2 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TREX1Q9NSU2 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TREX1Q9NSU2 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TREX1Q9NSU2 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TREX1Q9NSU2 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TREX1Q9NSU2 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TREX1Q9NSU2 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
TREX1Q9NSU2 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TREX1Q9NSU2 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TREX1Q9NSU2 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TREX1Q9NSU2 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TREX1Q9NSU2 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TREX1Q9NSU2 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TREX1Q9NSU2 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TREX1Q9NSU2 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TREX1Q9NSU2 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TREX1Q9NSU2 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TREX1Q9NSU2 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TREX1Q9NSU2 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TREX1Q9NSU2 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TREX1Q9NSU2 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TREX1Q9NSU2 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TREX1Q9NSU2 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TREX1Q9NSU2 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TREX1Q9NSU2 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TREX1Q9NSU2 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
TREX1Q9NSU2 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
TREX1Q9NSU2 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TREX1Q9NSU2 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TREX1Q9NSU2 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
TREX1Q9NSU2 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TREX1Q9NSU2 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TREX1Q9NSU2 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TREX1Q9NSU2 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TREX1Q9NSU2 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TREX1Q9NSU2 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TREX1Q9NSU2 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TREX1Q9NSU2 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TREX1Q9NSU2 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
TREX1Q9NSU2 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
TREX1Q9NSU2 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
TREX1Q9NSU2 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
TREX1Q9NSU2 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TREX1Q9NSU2 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TREX1Q9NSU2 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TREX1Q9NSU2 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TREX1Q9NSU2 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TREX1Q9NSU2 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TREX1Q9NSU2 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TREX1Q9NSU2 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TREX1Q9NSU2 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TREX1Q9NSU2 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TREX1Q9NSU2 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TREX1Q9NSU2 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TREX1Q9NSU2 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TREX1Q9NSU2 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TREX1Q9NSU2 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TREX1Q9NSU2 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
TREX1Q9NSU2 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TREX1Q9NSU2 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TREX1Q9NSU2 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TREX1Q9NSU2 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TREX1Q9NSU2 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TREX1Q9NSU2 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TREX1Q9NSU2 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TREX1Q9NSU2 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TREX1Q9NSU2 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TREX1Q9NSU2 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TREX1Q9NSU2 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TREX1Q9NSU2 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TREX1Q9NSU2 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TREX1Q9NSU2 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TREX1Q9NSU2 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TREX1Q9NSU2 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TREX1Q9NSU2 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TREX1Q9NSU2 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TREX1Q9NSU2 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TREX1Q9NSU2 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms