Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRF8

CTPS2, CTP synthase 2, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS2Q9NRF8 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTPS2Q9NRF8 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTPS2Q9NRF8 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTPS2Q9NRF8 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTPS2Q9NRF8 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTPS2Q9NRF8 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTPS2Q9NRF8 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTPS2Q9NRF8 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTPS2Q9NRF8 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTPS2Q9NRF8 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTPS2Q9NRF8 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTPS2Q9NRF8 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTPS2Q9NRF8 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTPS2Q9NRF8 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CTPS2Q9NRF8 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CTPS2Q9NRF8 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTPS2Q9NRF8 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CTPS2Q9NRF8 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTPS2Q9NRF8 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTPS2Q9NRF8 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTPS2Q9NRF8 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTPS2Q9NRF8 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTPS2Q9NRF8 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTPS2Q9NRF8 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTPS2Q9NRF8 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTPS2Q9NRF8 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTPS2Q9NRF8 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTPS2Q9NRF8 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTPS2Q9NRF8 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTPS2Q9NRF8 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CTPS2Q9NRF8 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTPS2Q9NRF8 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTPS2Q9NRF8 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTPS2Q9NRF8 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTPS2Q9NRF8 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTPS2Q9NRF8 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTPS2Q9NRF8 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTPS2Q9NRF8 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTPS2Q9NRF8 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTPS2Q9NRF8 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTPS2Q9NRF8 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTPS2Q9NRF8 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTPS2Q9NRF8 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTPS2Q9NRF8 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTPS2Q9NRF8 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTPS2Q9NRF8 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTPS2Q9NRF8 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CTPS2Q9NRF8 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTPS2Q9NRF8 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTPS2Q9NRF8 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTPS2Q9NRF8 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTPS2Q9NRF8 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTPS2Q9NRF8 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CTPS2Q9NRF8 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTPS2Q9NRF8 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CTPS2Q9NRF8 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTPS2Q9NRF8 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTPS2Q9NRF8 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTPS2Q9NRF8 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTPS2Q9NRF8 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTPS2Q9NRF8 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTPS2Q9NRF8 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTPS2Q9NRF8 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTPS2Q9NRF8 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTPS2Q9NRF8 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTPS2Q9NRF8 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTPS2Q9NRF8 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTPS2Q9NRF8 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTPS2Q9NRF8 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTPS2Q9NRF8 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTPS2Q9NRF8 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTPS2Q9NRF8 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTPS2Q9NRF8 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTPS2Q9NRF8 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTPS2Q9NRF8 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTPS2Q9NRF8 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTPS2Q9NRF8 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTPS2Q9NRF8 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTPS2Q9NRF8 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTPS2Q9NRF8 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTPS2Q9NRF8 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTPS2Q9NRF8 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTPS2Q9NRF8 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTPS2Q9NRF8 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTPS2Q9NRF8 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTPS2Q9NRF8 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTPS2Q9NRF8 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTPS2Q9NRF8 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTPS2Q9NRF8 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTPS2Q9NRF8 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTPS2Q9NRF8 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTPS2Q9NRF8 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTPS2Q9NRF8 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTPS2Q9NRF8 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CTPS2Q9NRF8 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTPS2Q9NRF8 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTPS2Q9NRF8 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CTPS2Q9NRF8 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTPS2Q9NRF8 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTPS2Q9NRF8 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms