Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAU4

SMURF2, E3 ubiquitin-protein ligase SMURF2, humanhuman

Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMURF2Q9HAU4 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMURF2Q9HAU4 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMURF2Q9HAU4 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMURF2Q9HAU4 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMURF2Q9HAU4 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMURF2Q9HAU4 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMURF2Q9HAU4 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMURF2Q9HAU4 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMURF2Q9HAU4 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMURF2Q9HAU4 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SMURF2Q9HAU4 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMURF2Q9HAU4 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMURF2Q9HAU4 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMURF2Q9HAU4 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMURF2Q9HAU4 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMURF2Q9HAU4 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMURF2Q9HAU4 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMURF2Q9HAU4 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMURF2Q9HAU4 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SMURF2Q9HAU4 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SMURF2Q9HAU4 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMURF2Q9HAU4 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SMURF2Q9HAU4 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMURF2Q9HAU4 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMURF2Q9HAU4 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMURF2Q9HAU4 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMURF2Q9HAU4 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMURF2Q9HAU4 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMURF2Q9HAU4 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMURF2Q9HAU4 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMURF2Q9HAU4 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMURF2Q9HAU4 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SMURF2Q9HAU4 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMURF2Q9HAU4 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMURF2Q9HAU4 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMURF2Q9HAU4 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMURF2Q9HAU4 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMURF2Q9HAU4 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SMURF2Q9HAU4 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMURF2Q9HAU4 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMURF2Q9HAU4 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMURF2Q9HAU4 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMURF2Q9HAU4 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMURF2Q9HAU4 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMURF2Q9HAU4 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMURF2Q9HAU4 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMURF2Q9HAU4 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMURF2Q9HAU4 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMURF2Q9HAU4 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMURF2Q9HAU4 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMURF2Q9HAU4 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SMURF2Q9HAU4 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SMURF2Q9HAU4 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMURF2Q9HAU4 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMURF2Q9HAU4 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMURF2Q9HAU4 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SMURF2Q9HAU4 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMURF2Q9HAU4 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMURF2Q9HAU4 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMURF2Q9HAU4 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SMURF2Q9HAU4 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SMURF2Q9HAU4 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMURF2Q9HAU4 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMURF2Q9HAU4 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMURF2Q9HAU4 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMURF2Q9HAU4 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMURF2Q9HAU4 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMURF2Q9HAU4 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMURF2Q9HAU4 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMURF2Q9HAU4 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMURF2Q9HAU4 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SMURF2Q9HAU4 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SMURF2Q9HAU4 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SMURF2Q9HAU4 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SMURF2Q9HAU4 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SMURF2Q9HAU4 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SMURF2Q9HAU4 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SMURF2Q9HAU4 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SMURF2Q9HAU4 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SMURF2Q9HAU4 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SMURF2Q9HAU4 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
SMURF2Q9HAU4 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
SMURF2Q9HAU4 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SMURF2Q9HAU4 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SMURF2Q9HAU4 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMURF2Q9HAU4 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMURF2Q9HAU4 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMURF2Q9HAU4 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMURF2Q9HAU4 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMURF2Q9HAU4 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMURF2Q9HAU4 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMURF2Q9HAU4 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMURF2Q9HAU4 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMURF2Q9HAU4 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMURF2Q9HAU4 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMURF2Q9HAU4 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMURF2Q9HAU4 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMURF2Q9HAU4 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMURF2Q9HAU4 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMURF2Q9HAU4 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms