Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0H6

KLHL4, Kelch-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL4Q9C0H6 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL4Q9C0H6 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL4Q9C0H6 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL4Q9C0H6 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL4Q9C0H6 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL4Q9C0H6 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL4Q9C0H6 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL4Q9C0H6 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL4Q9C0H6 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL4Q9C0H6 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL4Q9C0H6 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL4Q9C0H6 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL4Q9C0H6 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL4Q9C0H6 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL4Q9C0H6 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL4Q9C0H6 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL4Q9C0H6 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL4Q9C0H6 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL4Q9C0H6 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL4Q9C0H6 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL4Q9C0H6 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL4Q9C0H6 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL4Q9C0H6 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL4Q9C0H6 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL4Q9C0H6 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL4Q9C0H6 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL4Q9C0H6 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL4Q9C0H6 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL4Q9C0H6 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL4Q9C0H6 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL4Q9C0H6 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL4Q9C0H6 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL4Q9C0H6 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL4Q9C0H6 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL4Q9C0H6 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL4Q9C0H6 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL4Q9C0H6 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL4Q9C0H6 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL4Q9C0H6 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL4Q9C0H6 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL4Q9C0H6 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL4Q9C0H6 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL4Q9C0H6 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL4Q9C0H6 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL4Q9C0H6 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL4Q9C0H6 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL4Q9C0H6 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL4Q9C0H6 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL4Q9C0H6 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL4Q9C0H6 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL4Q9C0H6 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL4Q9C0H6 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL4Q9C0H6 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL4Q9C0H6 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL4Q9C0H6 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL4Q9C0H6 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL4Q9C0H6 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL4Q9C0H6 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL4Q9C0H6 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL4Q9C0H6 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL4Q9C0H6 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL4Q9C0H6 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL4Q9C0H6 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL4Q9C0H6 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL4Q9C0H6 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL4Q9C0H6 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL4Q9C0H6 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL4Q9C0H6 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL4Q9C0H6 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL4Q9C0H6 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL4Q9C0H6 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL4Q9C0H6 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL4Q9C0H6 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL4Q9C0H6 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL4Q9C0H6 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL4Q9C0H6 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL4Q9C0H6 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL4Q9C0H6 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL4Q9C0H6 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL4Q9C0H6 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL4Q9C0H6 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL4Q9C0H6 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL4Q9C0H6 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL4Q9C0H6 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL4Q9C0H6 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL4Q9C0H6 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL4Q9C0H6 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL4Q9C0H6 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL4Q9C0H6 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL4Q9C0H6 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL4Q9C0H6 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL4Q9C0H6 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL4Q9C0H6 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL4Q9C0H6 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL4Q9C0H6 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL4Q9C0H6 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL4Q9C0H6 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL4Q9C0H6 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL4Q9C0H6 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL4Q9C0H6 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms