Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C7

AMBRA1, Activating molecule in BECN1-regulated autophagy protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMBRA1Q9C0C7 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AMBRA1Q9C0C7 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AMBRA1Q9C0C7 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AMBRA1Q9C0C7 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AMBRA1Q9C0C7 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AMBRA1Q9C0C7 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AMBRA1Q9C0C7 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AMBRA1Q9C0C7 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AMBRA1Q9C0C7 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AMBRA1Q9C0C7 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AMBRA1Q9C0C7 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AMBRA1Q9C0C7 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AMBRA1Q9C0C7 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AMBRA1Q9C0C7 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AMBRA1Q9C0C7 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AMBRA1Q9C0C7 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AMBRA1Q9C0C7 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AMBRA1Q9C0C7 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
AMBRA1Q9C0C7 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AMBRA1Q9C0C7 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
AMBRA1Q9C0C7 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
AMBRA1Q9C0C7 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AMBRA1Q9C0C7 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AMBRA1Q9C0C7 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AMBRA1Q9C0C7 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AMBRA1Q9C0C7 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AMBRA1Q9C0C7 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AMBRA1Q9C0C7 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AMBRA1Q9C0C7 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AMBRA1Q9C0C7 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AMBRA1Q9C0C7 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AMBRA1Q9C0C7 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AMBRA1Q9C0C7 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AMBRA1Q9C0C7 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AMBRA1Q9C0C7 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AMBRA1Q9C0C7 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AMBRA1Q9C0C7 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AMBRA1Q9C0C7 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AMBRA1Q9C0C7 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AMBRA1Q9C0C7 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AMBRA1Q9C0C7 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AMBRA1Q9C0C7 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AMBRA1Q9C0C7 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AMBRA1Q9C0C7 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AMBRA1Q9C0C7 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AMBRA1Q9C0C7 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AMBRA1Q9C0C7 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
AMBRA1Q9C0C7 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
AMBRA1Q9C0C7 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AMBRA1Q9C0C7 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AMBRA1Q9C0C7 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AMBRA1Q9C0C7 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AMBRA1Q9C0C7 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AMBRA1Q9C0C7 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AMBRA1Q9C0C7 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AMBRA1Q9C0C7 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AMBRA1Q9C0C7 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AMBRA1Q9C0C7 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
AMBRA1Q9C0C7 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
AMBRA1Q9C0C7 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AMBRA1Q9C0C7 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AMBRA1Q9C0C7 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AMBRA1Q9C0C7 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AMBRA1Q9C0C7 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AMBRA1Q9C0C7 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
AMBRA1Q9C0C7 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AMBRA1Q9C0C7 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AMBRA1Q9C0C7 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AMBRA1Q9C0C7 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AMBRA1Q9C0C7 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AMBRA1Q9C0C7 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AMBRA1Q9C0C7 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AMBRA1Q9C0C7 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AMBRA1Q9C0C7 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AMBRA1Q9C0C7 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AMBRA1Q9C0C7 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AMBRA1Q9C0C7 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AMBRA1Q9C0C7 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AMBRA1Q9C0C7 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AMBRA1Q9C0C7 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AMBRA1Q9C0C7 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AMBRA1Q9C0C7 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AMBRA1Q9C0C7 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AMBRA1Q9C0C7 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AMBRA1Q9C0C7 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AMBRA1Q9C0C7 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AMBRA1Q9C0C7 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AMBRA1Q9C0C7 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AMBRA1Q9C0C7 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AMBRA1Q9C0C7 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AMBRA1Q9C0C7 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AMBRA1Q9C0C7 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AMBRA1Q9C0C7 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AMBRA1Q9C0C7 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AMBRA1Q9C0C7 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AMBRA1Q9C0C7 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
AMBRA1Q9C0C7 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AMBRA1Q9C0C7 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AMBRA1Q9C0C7 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AMBRA1Q9C0C7 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms