Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

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Length 399 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CIPCQ9C0C6 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CIPCQ9C0C6 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CIPCQ9C0C6 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CIPCQ9C0C6 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CIPCQ9C0C6 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CIPCQ9C0C6 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CIPCQ9C0C6 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CIPCQ9C0C6 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CIPCQ9C0C6 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CIPCQ9C0C6 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CIPCQ9C0C6 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CIPCQ9C0C6 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CIPCQ9C0C6 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CIPCQ9C0C6 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CIPCQ9C0C6 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CIPCQ9C0C6 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CIPCQ9C0C6 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CIPCQ9C0C6 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CIPCQ9C0C6 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CIPCQ9C0C6 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CIPCQ9C0C6 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CIPCQ9C0C6 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CIPCQ9C0C6 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CIPCQ9C0C6 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CIPCQ9C0C6 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CIPCQ9C0C6 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CIPCQ9C0C6 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CIPCQ9C0C6 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CIPCQ9C0C6 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CIPCQ9C0C6 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CIPCQ9C0C6 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CIPCQ9C0C6 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CIPCQ9C0C6 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CIPCQ9C0C6 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CIPCQ9C0C6 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CIPCQ9C0C6 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CIPCQ9C0C6 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CIPCQ9C0C6 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CIPCQ9C0C6 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CIPCQ9C0C6 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CIPCQ9C0C6 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CIPCQ9C0C6 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CIPCQ9C0C6 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CIPCQ9C0C6 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CIPCQ9C0C6 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CIPCQ9C0C6 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CIPCQ9C0C6 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CIPCQ9C0C6 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CIPCQ9C0C6 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CIPCQ9C0C6 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CIPCQ9C0C6 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CIPCQ9C0C6 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CIPCQ9C0C6 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CIPCQ9C0C6 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CIPCQ9C0C6 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CIPCQ9C0C6 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CIPCQ9C0C6 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CIPCQ9C0C6 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CIPCQ9C0C6 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CIPCQ9C0C6 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CIPCQ9C0C6 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CIPCQ9C0C6 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CIPCQ9C0C6 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CIPCQ9C0C6 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CIPCQ9C0C6 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CIPCQ9C0C6 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CIPCQ9C0C6 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CIPCQ9C0C6 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CIPCQ9C0C6 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CIPCQ9C0C6 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
CIPCQ9C0C6 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CIPCQ9C0C6 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CIPCQ9C0C6 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CIPCQ9C0C6 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CIPCQ9C0C6 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CIPCQ9C0C6 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CIPCQ9C0C6 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CIPCQ9C0C6 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CIPCQ9C0C6 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CIPCQ9C0C6 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CIPCQ9C0C6 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CIPCQ9C0C6 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CIPCQ9C0C6 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CIPCQ9C0C6 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CIPCQ9C0C6 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CIPCQ9C0C6 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CIPCQ9C0C6 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CIPCQ9C0C6 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
CIPCQ9C0C6 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CIPCQ9C0C6 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CIPCQ9C0C6 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CIPCQ9C0C6 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CIPCQ9C0C6 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CIPCQ9C0C6 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CIPCQ9C0C6 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CIPCQ9C0C6 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CIPCQ9C0C6 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CIPCQ9C0C6 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CIPCQ9C0C6 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
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