Protein–RNA interactions for Protein: Q9C035

TRIM5, Tripartite motif-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM5Q9C035 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRIM5Q9C035 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRIM5Q9C035 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRIM5Q9C035 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRIM5Q9C035 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRIM5Q9C035 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
TRIM5Q9C035 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
TRIM5Q9C035 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRIM5Q9C035 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRIM5Q9C035 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRIM5Q9C035 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRIM5Q9C035 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRIM5Q9C035 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRIM5Q9C035 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRIM5Q9C035 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRIM5Q9C035 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRIM5Q9C035 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRIM5Q9C035 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRIM5Q9C035 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRIM5Q9C035 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRIM5Q9C035 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRIM5Q9C035 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRIM5Q9C035 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRIM5Q9C035 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRIM5Q9C035 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRIM5Q9C035 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
TRIM5Q9C035 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRIM5Q9C035 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRIM5Q9C035 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRIM5Q9C035 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRIM5Q9C035 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRIM5Q9C035 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRIM5Q9C035 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRIM5Q9C035 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRIM5Q9C035 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRIM5Q9C035 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRIM5Q9C035 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
TRIM5Q9C035 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
TRIM5Q9C035 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRIM5Q9C035 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRIM5Q9C035 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRIM5Q9C035 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRIM5Q9C035 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRIM5Q9C035 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
TRIM5Q9C035 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRIM5Q9C035 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRIM5Q9C035 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRIM5Q9C035 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRIM5Q9C035 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRIM5Q9C035 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRIM5Q9C035 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRIM5Q9C035 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRIM5Q9C035 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRIM5Q9C035 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRIM5Q9C035 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRIM5Q9C035 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRIM5Q9C035 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRIM5Q9C035 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRIM5Q9C035 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRIM5Q9C035 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIM5Q9C035 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIM5Q9C035 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIM5Q9C035 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIM5Q9C035 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIM5Q9C035 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIM5Q9C035 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIM5Q9C035 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIM5Q9C035 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIM5Q9C035 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIM5Q9C035 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIM5Q9C035 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIM5Q9C035 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIM5Q9C035 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIM5Q9C035 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIM5Q9C035 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIM5Q9C035 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIM5Q9C035 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIM5Q9C035 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIM5Q9C035 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIM5Q9C035 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIM5Q9C035 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIM5Q9C035 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIM5Q9C035 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIM5Q9C035 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIM5Q9C035 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIM5Q9C035 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIM5Q9C035 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIM5Q9C035 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIM5Q9C035 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIM5Q9C035 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIM5Q9C035 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIM5Q9C035 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIM5Q9C035 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIM5Q9C035 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIM5Q9C035 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM5Q9C035 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM5Q9C035 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM5Q9C035 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM5Q9C035 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM5Q9C035 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms