Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZX4

ROPN1B, Ropporin-1B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROPN1BQ9BZX4 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ROPN1BQ9BZX4 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ROPN1BQ9BZX4 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ROPN1BQ9BZX4 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ROPN1BQ9BZX4 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ROPN1BQ9BZX4 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ROPN1BQ9BZX4 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ROPN1BQ9BZX4 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ROPN1BQ9BZX4 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ROPN1BQ9BZX4 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ROPN1BQ9BZX4 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ROPN1BQ9BZX4 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ROPN1BQ9BZX4 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ROPN1BQ9BZX4 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ROPN1BQ9BZX4 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ROPN1BQ9BZX4 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ROPN1BQ9BZX4 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ROPN1BQ9BZX4 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ROPN1BQ9BZX4 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ROPN1BQ9BZX4 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ROPN1BQ9BZX4 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ROPN1BQ9BZX4 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ROPN1BQ9BZX4 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ROPN1BQ9BZX4 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ROPN1BQ9BZX4 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ROPN1BQ9BZX4 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ROPN1BQ9BZX4 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ROPN1BQ9BZX4 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ROPN1BQ9BZX4 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ROPN1BQ9BZX4 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ROPN1BQ9BZX4 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ROPN1BQ9BZX4 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ROPN1BQ9BZX4 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ROPN1BQ9BZX4 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ROPN1BQ9BZX4 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ROPN1BQ9BZX4 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ROPN1BQ9BZX4 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ROPN1BQ9BZX4 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ROPN1BQ9BZX4 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ROPN1BQ9BZX4 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ROPN1BQ9BZX4 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ROPN1BQ9BZX4 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ROPN1BQ9BZX4 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ROPN1BQ9BZX4 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ROPN1BQ9BZX4 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ROPN1BQ9BZX4 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ROPN1BQ9BZX4 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ROPN1BQ9BZX4 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ROPN1BQ9BZX4 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ROPN1BQ9BZX4 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ROPN1BQ9BZX4 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ROPN1BQ9BZX4 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ROPN1BQ9BZX4 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ROPN1BQ9BZX4 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ROPN1BQ9BZX4 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ROPN1BQ9BZX4 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ROPN1BQ9BZX4 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ROPN1BQ9BZX4 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ROPN1BQ9BZX4 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ROPN1BQ9BZX4 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ROPN1BQ9BZX4 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ROPN1BQ9BZX4 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ROPN1BQ9BZX4 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ROPN1BQ9BZX4 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ROPN1BQ9BZX4 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ROPN1BQ9BZX4 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ROPN1BQ9BZX4 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ROPN1BQ9BZX4 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ROPN1BQ9BZX4 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ROPN1BQ9BZX4 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ROPN1BQ9BZX4 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ROPN1BQ9BZX4 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ROPN1BQ9BZX4 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ROPN1BQ9BZX4 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ROPN1BQ9BZX4 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ROPN1BQ9BZX4 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ROPN1BQ9BZX4 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ROPN1BQ9BZX4 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ROPN1BQ9BZX4 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ROPN1BQ9BZX4 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ROPN1BQ9BZX4 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ROPN1BQ9BZX4 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ROPN1BQ9BZX4 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ROPN1BQ9BZX4 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ROPN1BQ9BZX4 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ROPN1BQ9BZX4 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ROPN1BQ9BZX4 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ROPN1BQ9BZX4 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ROPN1BQ9BZX4 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ROPN1BQ9BZX4 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ROPN1BQ9BZX4 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ROPN1BQ9BZX4 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ROPN1BQ9BZX4 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ROPN1BQ9BZX4 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ROPN1BQ9BZX4 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ROPN1BQ9BZX4 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ROPN1BQ9BZX4 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ROPN1BQ9BZX4 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ROPN1BQ9BZX4 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ROPN1BQ9BZX4 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms