Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYR9

KRTAP2-4, Keratin-associated protein 2-4, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP2-4Q9BYR9 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 HFE-203ENST00000336625 804 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 MYL3-202ENST00000395869 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 ATP5J-202ENST00000400087 826 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 PFN2-202ENST00000423691 911 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 IFI35-204ENST00000438323 1232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 AL451069.3-201ENST00000450206 1013 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 RN7SL181P-201ENST00000462921 277 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 REEP5-205ENST00000504247 480 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 REEP5-207ENST00000513339 1139 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 RAP1B-216ENST00000537460 1072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 AL118516.1-201ENST00000564152 670 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 GACAT2-201ENST00000579368 818 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 TLE2-205ENST00000586422 389 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 HCG18-241ENST00000602290 821 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 MIR6125-201ENST00000618986 96 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 CTSV-201ENST00000259470 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC6.02□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms