Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT8

RNF17, RING finger protein 17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF17Q9BXT8 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
RNF17Q9BXT8 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RNF17Q9BXT8 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
RNF17Q9BXT8 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
RNF17Q9BXT8 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RNF17Q9BXT8 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RNF17Q9BXT8 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RNF17Q9BXT8 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RNF17Q9BXT8 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RNF17Q9BXT8 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
RNF17Q9BXT8 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RNF17Q9BXT8 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RNF17Q9BXT8 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RNF17Q9BXT8 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RNF17Q9BXT8 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RNF17Q9BXT8 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
RNF17Q9BXT8 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RNF17Q9BXT8 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RNF17Q9BXT8 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RNF17Q9BXT8 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
RNF17Q9BXT8 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RNF17Q9BXT8 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RNF17Q9BXT8 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RNF17Q9BXT8 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
RNF17Q9BXT8 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RNF17Q9BXT8 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RNF17Q9BXT8 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RNF17Q9BXT8 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
RNF17Q9BXT8 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RNF17Q9BXT8 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
RNF17Q9BXT8 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RNF17Q9BXT8 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RNF17Q9BXT8 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RNF17Q9BXT8 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RNF17Q9BXT8 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RNF17Q9BXT8 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RNF17Q9BXT8 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RNF17Q9BXT8 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RNF17Q9BXT8 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RNF17Q9BXT8 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RNF17Q9BXT8 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RNF17Q9BXT8 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RNF17Q9BXT8 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RNF17Q9BXT8 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RNF17Q9BXT8 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
RNF17Q9BXT8 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RNF17Q9BXT8 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
RNF17Q9BXT8 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
RNF17Q9BXT8 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
RNF17Q9BXT8 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
RNF17Q9BXT8 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RNF17Q9BXT8 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
RNF17Q9BXT8 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RNF17Q9BXT8 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RNF17Q9BXT8 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RNF17Q9BXT8 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RNF17Q9BXT8 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RNF17Q9BXT8 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RNF17Q9BXT8 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RNF17Q9BXT8 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RNF17Q9BXT8 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RNF17Q9BXT8 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RNF17Q9BXT8 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RNF17Q9BXT8 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RNF17Q9BXT8 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RNF17Q9BXT8 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RNF17Q9BXT8 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RNF17Q9BXT8 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RNF17Q9BXT8 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RNF17Q9BXT8 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RNF17Q9BXT8 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RNF17Q9BXT8 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RNF17Q9BXT8 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RNF17Q9BXT8 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
RNF17Q9BXT8 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
RNF17Q9BXT8 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RNF17Q9BXT8 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
RNF17Q9BXT8 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
RNF17Q9BXT8 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RNF17Q9BXT8 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RNF17Q9BXT8 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RNF17Q9BXT8 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RNF17Q9BXT8 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
RNF17Q9BXT8 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RNF17Q9BXT8 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RNF17Q9BXT8 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RNF17Q9BXT8 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RNF17Q9BXT8 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RNF17Q9BXT8 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RNF17Q9BXT8 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
RNF17Q9BXT8 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RNF17Q9BXT8 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RNF17Q9BXT8 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RNF17Q9BXT8 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RNF17Q9BXT8 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
RNF17Q9BXT8 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
RNF17Q9BXT8 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
RNF17Q9BXT8 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
RNF17Q9BXT8 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
RNF17Q9BXT8 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms