Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX26

SYCP2, Synaptonemal complex protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP2Q9BX26 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SYCP2Q9BX26 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SYCP2Q9BX26 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SYCP2Q9BX26 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SYCP2Q9BX26 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SYCP2Q9BX26 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SYCP2Q9BX26 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SYCP2Q9BX26 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SYCP2Q9BX26 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SYCP2Q9BX26 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SYCP2Q9BX26 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SYCP2Q9BX26 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SYCP2Q9BX26 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SYCP2Q9BX26 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SYCP2Q9BX26 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SYCP2Q9BX26 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SYCP2Q9BX26 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SYCP2Q9BX26 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SYCP2Q9BX26 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SYCP2Q9BX26 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SYCP2Q9BX26 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SYCP2Q9BX26 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SYCP2Q9BX26 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SYCP2Q9BX26 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SYCP2Q9BX26 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SYCP2Q9BX26 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SYCP2Q9BX26 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SYCP2Q9BX26 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SYCP2Q9BX26 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SYCP2Q9BX26 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SYCP2Q9BX26 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SYCP2Q9BX26 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SYCP2Q9BX26 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SYCP2Q9BX26 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SYCP2Q9BX26 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SYCP2Q9BX26 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SYCP2Q9BX26 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SYCP2Q9BX26 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SYCP2Q9BX26 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SYCP2Q9BX26 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SYCP2Q9BX26 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SYCP2Q9BX26 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SYCP2Q9BX26 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SYCP2Q9BX26 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SYCP2Q9BX26 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SYCP2Q9BX26 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SYCP2Q9BX26 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SYCP2Q9BX26 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SYCP2Q9BX26 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SYCP2Q9BX26 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SYCP2Q9BX26 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SYCP2Q9BX26 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SYCP2Q9BX26 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SYCP2Q9BX26 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SYCP2Q9BX26 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SYCP2Q9BX26 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SYCP2Q9BX26 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SYCP2Q9BX26 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SYCP2Q9BX26 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SYCP2Q9BX26 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SYCP2Q9BX26 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SYCP2Q9BX26 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SYCP2Q9BX26 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SYCP2Q9BX26 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SYCP2Q9BX26 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SYCP2Q9BX26 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SYCP2Q9BX26 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SYCP2Q9BX26 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SYCP2Q9BX26 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SYCP2Q9BX26 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SYCP2Q9BX26 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SYCP2Q9BX26 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SYCP2Q9BX26 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SYCP2Q9BX26 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SYCP2Q9BX26 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SYCP2Q9BX26 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SYCP2Q9BX26 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SYCP2Q9BX26 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SYCP2Q9BX26 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SYCP2Q9BX26 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SYCP2Q9BX26 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SYCP2Q9BX26 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SYCP2Q9BX26 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SYCP2Q9BX26 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SYCP2Q9BX26 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SYCP2Q9BX26 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SYCP2Q9BX26 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SYCP2Q9BX26 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SYCP2Q9BX26 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SYCP2Q9BX26 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SYCP2Q9BX26 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SYCP2Q9BX26 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SYCP2Q9BX26 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SYCP2Q9BX26 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SYCP2Q9BX26 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SYCP2Q9BX26 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SYCP2Q9BX26 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SYCP2Q9BX26 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SYCP2Q9BX26 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SYCP2Q9BX26 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms