Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUW7

C9orf16, UPF0184 protein C9orf16, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf16Q9BUW7 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf16Q9BUW7 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf16Q9BUW7 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf16Q9BUW7 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf16Q9BUW7 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf16Q9BUW7 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf16Q9BUW7 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf16Q9BUW7 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf16Q9BUW7 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf16Q9BUW7 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf16Q9BUW7 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf16Q9BUW7 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf16Q9BUW7 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf16Q9BUW7 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf16Q9BUW7 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf16Q9BUW7 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf16Q9BUW7 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf16Q9BUW7 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf16Q9BUW7 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf16Q9BUW7 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf16Q9BUW7 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf16Q9BUW7 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf16Q9BUW7 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf16Q9BUW7 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf16Q9BUW7 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf16Q9BUW7 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf16Q9BUW7 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf16Q9BUW7 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf16Q9BUW7 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf16Q9BUW7 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf16Q9BUW7 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf16Q9BUW7 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf16Q9BUW7 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf16Q9BUW7 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf16Q9BUW7 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf16Q9BUW7 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf16Q9BUW7 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf16Q9BUW7 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf16Q9BUW7 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf16Q9BUW7 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf16Q9BUW7 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf16Q9BUW7 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf16Q9BUW7 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf16Q9BUW7 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf16Q9BUW7 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf16Q9BUW7 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf16Q9BUW7 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf16Q9BUW7 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf16Q9BUW7 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf16Q9BUW7 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf16Q9BUW7 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf16Q9BUW7 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf16Q9BUW7 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf16Q9BUW7 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf16Q9BUW7 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf16Q9BUW7 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf16Q9BUW7 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf16Q9BUW7 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf16Q9BUW7 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf16Q9BUW7 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf16Q9BUW7 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf16Q9BUW7 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf16Q9BUW7 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf16Q9BUW7 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf16Q9BUW7 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf16Q9BUW7 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf16Q9BUW7 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf16Q9BUW7 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf16Q9BUW7 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf16Q9BUW7 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf16Q9BUW7 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf16Q9BUW7 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf16Q9BUW7 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf16Q9BUW7 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf16Q9BUW7 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf16Q9BUW7 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf16Q9BUW7 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf16Q9BUW7 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf16Q9BUW7 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf16Q9BUW7 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf16Q9BUW7 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf16Q9BUW7 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf16Q9BUW7 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf16Q9BUW7 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf16Q9BUW7 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf16Q9BUW7 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf16Q9BUW7 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf16Q9BUW7 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf16Q9BUW7 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf16Q9BUW7 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf16Q9BUW7 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf16Q9BUW7 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf16Q9BUW7 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf16Q9BUW7 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf16Q9BUW7 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf16Q9BUW7 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf16Q9BUW7 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf16Q9BUW7 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf16Q9BUW7 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf16Q9BUW7 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms