Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUP0

EFHD1, EF-hand domain-containing protein D1, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFHD1Q9BUP0 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
EFHD1Q9BUP0 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
EFHD1Q9BUP0 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EFHD1Q9BUP0 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EFHD1Q9BUP0 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EFHD1Q9BUP0 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EFHD1Q9BUP0 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EFHD1Q9BUP0 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EFHD1Q9BUP0 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EFHD1Q9BUP0 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EFHD1Q9BUP0 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EFHD1Q9BUP0 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EFHD1Q9BUP0 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EFHD1Q9BUP0 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EFHD1Q9BUP0 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EFHD1Q9BUP0 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
EFHD1Q9BUP0 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EFHD1Q9BUP0 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EFHD1Q9BUP0 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
EFHD1Q9BUP0 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
EFHD1Q9BUP0 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
EFHD1Q9BUP0 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EFHD1Q9BUP0 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EFHD1Q9BUP0 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
EFHD1Q9BUP0 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
EFHD1Q9BUP0 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EFHD1Q9BUP0 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
EFHD1Q9BUP0 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EFHD1Q9BUP0 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
EFHD1Q9BUP0 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
EFHD1Q9BUP0 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
EFHD1Q9BUP0 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
EFHD1Q9BUP0 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EFHD1Q9BUP0 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EFHD1Q9BUP0 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EFHD1Q9BUP0 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EFHD1Q9BUP0 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
EFHD1Q9BUP0 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
EFHD1Q9BUP0 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
EFHD1Q9BUP0 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
EFHD1Q9BUP0 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
EFHD1Q9BUP0 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
EFHD1Q9BUP0 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
EFHD1Q9BUP0 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EFHD1Q9BUP0 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EFHD1Q9BUP0 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EFHD1Q9BUP0 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EFHD1Q9BUP0 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EFHD1Q9BUP0 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EFHD1Q9BUP0 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EFHD1Q9BUP0 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EFHD1Q9BUP0 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EFHD1Q9BUP0 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EFHD1Q9BUP0 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EFHD1Q9BUP0 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EFHD1Q9BUP0 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EFHD1Q9BUP0 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EFHD1Q9BUP0 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EFHD1Q9BUP0 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EFHD1Q9BUP0 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EFHD1Q9BUP0 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EFHD1Q9BUP0 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EFHD1Q9BUP0 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EFHD1Q9BUP0 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
EFHD1Q9BUP0 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EFHD1Q9BUP0 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EFHD1Q9BUP0 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
EFHD1Q9BUP0 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EFHD1Q9BUP0 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EFHD1Q9BUP0 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
EFHD1Q9BUP0 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EFHD1Q9BUP0 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EFHD1Q9BUP0 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EFHD1Q9BUP0 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
EFHD1Q9BUP0 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EFHD1Q9BUP0 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EFHD1Q9BUP0 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EFHD1Q9BUP0 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EFHD1Q9BUP0 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EFHD1Q9BUP0 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EFHD1Q9BUP0 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EFHD1Q9BUP0 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EFHD1Q9BUP0 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EFHD1Q9BUP0 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EFHD1Q9BUP0 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EFHD1Q9BUP0 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EFHD1Q9BUP0 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EFHD1Q9BUP0 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EFHD1Q9BUP0 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EFHD1Q9BUP0 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EFHD1Q9BUP0 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EFHD1Q9BUP0 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EFHD1Q9BUP0 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
EFHD1Q9BUP0 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EFHD1Q9BUP0 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EFHD1Q9BUP0 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EFHD1Q9BUP0 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EFHD1Q9BUP0 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EFHD1Q9BUP0 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EFHD1Q9BUP0 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms