Protein–RNA interactions for Protein: Q99607

ELF4, ETS-related transcription factor Elf-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 663 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELF4Q99607 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ELF4Q99607 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ELF4Q99607 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ELF4Q99607 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ELF4Q99607 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ELF4Q99607 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ELF4Q99607 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ELF4Q99607 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ELF4Q99607 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ELF4Q99607 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ELF4Q99607 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ELF4Q99607 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ELF4Q99607 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ELF4Q99607 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ELF4Q99607 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ELF4Q99607 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ELF4Q99607 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ELF4Q99607 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ELF4Q99607 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ELF4Q99607 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ELF4Q99607 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ELF4Q99607 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ELF4Q99607 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ELF4Q99607 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ELF4Q99607 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ELF4Q99607 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ELF4Q99607 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ELF4Q99607 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ELF4Q99607 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ELF4Q99607 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ELF4Q99607 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ELF4Q99607 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ELF4Q99607 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ELF4Q99607 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ELF4Q99607 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ELF4Q99607 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ELF4Q99607 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ELF4Q99607 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ELF4Q99607 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ELF4Q99607 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ELF4Q99607 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ELF4Q99607 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ELF4Q99607 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ELF4Q99607 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ELF4Q99607 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ELF4Q99607 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ELF4Q99607 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ELF4Q99607 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ELF4Q99607 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ELF4Q99607 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ELF4Q99607 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ELF4Q99607 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ELF4Q99607 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ELF4Q99607 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ELF4Q99607 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ELF4Q99607 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ELF4Q99607 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ELF4Q99607 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ELF4Q99607 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ELF4Q99607 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ELF4Q99607 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ELF4Q99607 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ELF4Q99607 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ELF4Q99607 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ELF4Q99607 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ELF4Q99607 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ELF4Q99607 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ELF4Q99607 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ELF4Q99607 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ELF4Q99607 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ELF4Q99607 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ELF4Q99607 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ELF4Q99607 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ELF4Q99607 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ELF4Q99607 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ELF4Q99607 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ELF4Q99607 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ELF4Q99607 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ELF4Q99607 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ELF4Q99607 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
ELF4Q99607 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ELF4Q99607 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ELF4Q99607 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ELF4Q99607 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ELF4Q99607 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ELF4Q99607 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ELF4Q99607 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ELF4Q99607 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ELF4Q99607 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ELF4Q99607 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ELF4Q99607 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ELF4Q99607 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ELF4Q99607 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ELF4Q99607 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ELF4Q99607 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ELF4Q99607 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ELF4Q99607 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ELF4Q99607 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ELF4Q99607 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ELF4Q99607 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms