Protein–RNA interactions for Protein: Q96P69

GPR78, G-protein coupled receptor 78, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPR78Q96P69 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GPR78Q96P69 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GPR78Q96P69 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GPR78Q96P69 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
GPR78Q96P69 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
GPR78Q96P69 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GPR78Q96P69 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GPR78Q96P69 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GPR78Q96P69 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GPR78Q96P69 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
GPR78Q96P69 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GPR78Q96P69 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GPR78Q96P69 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GPR78Q96P69 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GPR78Q96P69 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GPR78Q96P69 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GPR78Q96P69 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GPR78Q96P69 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GPR78Q96P69 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GPR78Q96P69 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GPR78Q96P69 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GPR78Q96P69 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GPR78Q96P69 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GPR78Q96P69 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GPR78Q96P69 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GPR78Q96P69 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GPR78Q96P69 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GPR78Q96P69 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GPR78Q96P69 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GPR78Q96P69 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GPR78Q96P69 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
GPR78Q96P69 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
GPR78Q96P69 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GPR78Q96P69 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GPR78Q96P69 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GPR78Q96P69 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GPR78Q96P69 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GPR78Q96P69 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GPR78Q96P69 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GPR78Q96P69 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GPR78Q96P69 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GPR78Q96P69 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GPR78Q96P69 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GPR78Q96P69 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GPR78Q96P69 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GPR78Q96P69 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GPR78Q96P69 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
GPR78Q96P69 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GPR78Q96P69 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
GPR78Q96P69 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GPR78Q96P69 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GPR78Q96P69 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GPR78Q96P69 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GPR78Q96P69 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GPR78Q96P69 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
GPR78Q96P69 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GPR78Q96P69 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GPR78Q96P69 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
GPR78Q96P69 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GPR78Q96P69 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GPR78Q96P69 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GPR78Q96P69 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GPR78Q96P69 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GPR78Q96P69 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GPR78Q96P69 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GPR78Q96P69 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GPR78Q96P69 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GPR78Q96P69 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GPR78Q96P69 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GPR78Q96P69 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GPR78Q96P69 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GPR78Q96P69 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GPR78Q96P69 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GPR78Q96P69 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GPR78Q96P69 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GPR78Q96P69 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GPR78Q96P69 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GPR78Q96P69 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GPR78Q96P69 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GPR78Q96P69 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GPR78Q96P69 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GPR78Q96P69 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GPR78Q96P69 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GPR78Q96P69 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GPR78Q96P69 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GPR78Q96P69 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GPR78Q96P69 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GPR78Q96P69 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GPR78Q96P69 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GPR78Q96P69 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GPR78Q96P69 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GPR78Q96P69 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GPR78Q96P69 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GPR78Q96P69 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GPR78Q96P69 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GPR78Q96P69 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GPR78Q96P69 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GPR78Q96P69 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GPR78Q96P69 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GPR78Q96P69 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.4 ms