Protein–RNA interactions for Protein: Q96M96

FGD4, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD4Q96M96 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
FGD4Q96M96 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
FGD4Q96M96 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
FGD4Q96M96 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
FGD4Q96M96 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
FGD4Q96M96 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
FGD4Q96M96 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
FGD4Q96M96 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
FGD4Q96M96 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
FGD4Q96M96 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
FGD4Q96M96 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
FGD4Q96M96 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
FGD4Q96M96 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
FGD4Q96M96 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
FGD4Q96M96 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
FGD4Q96M96 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FGD4Q96M96 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
FGD4Q96M96 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FGD4Q96M96 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FGD4Q96M96 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FGD4Q96M96 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
FGD4Q96M96 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FGD4Q96M96 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FGD4Q96M96 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
FGD4Q96M96 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
FGD4Q96M96 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
FGD4Q96M96 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FGD4Q96M96 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
FGD4Q96M96 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FGD4Q96M96 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
FGD4Q96M96 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
FGD4Q96M96 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
FGD4Q96M96 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FGD4Q96M96 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FGD4Q96M96 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FGD4Q96M96 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
FGD4Q96M96 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
FGD4Q96M96 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FGD4Q96M96 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FGD4Q96M96 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FGD4Q96M96 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FGD4Q96M96 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FGD4Q96M96 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
FGD4Q96M96 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FGD4Q96M96 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FGD4Q96M96 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
FGD4Q96M96 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
FGD4Q96M96 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FGD4Q96M96 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
FGD4Q96M96 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FGD4Q96M96 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FGD4Q96M96 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
FGD4Q96M96 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FGD4Q96M96 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FGD4Q96M96 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FGD4Q96M96 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FGD4Q96M96 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
FGD4Q96M96 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
FGD4Q96M96 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FGD4Q96M96 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
FGD4Q96M96 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
FGD4Q96M96 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
FGD4Q96M96 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
FGD4Q96M96 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
FGD4Q96M96 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FGD4Q96M96 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
FGD4Q96M96 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
FGD4Q96M96 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
FGD4Q96M96 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
FGD4Q96M96 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
FGD4Q96M96 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
FGD4Q96M96 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
FGD4Q96M96 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FGD4Q96M96 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
FGD4Q96M96 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
FGD4Q96M96 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
FGD4Q96M96 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FGD4Q96M96 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FGD4Q96M96 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FGD4Q96M96 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
FGD4Q96M96 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FGD4Q96M96 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
FGD4Q96M96 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FGD4Q96M96 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FGD4Q96M96 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FGD4Q96M96 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FGD4Q96M96 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
FGD4Q96M96 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FGD4Q96M96 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FGD4Q96M96 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
FGD4Q96M96 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
FGD4Q96M96 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
FGD4Q96M96 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
FGD4Q96M96 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
FGD4Q96M96 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FGD4Q96M96 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
FGD4Q96M96 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
FGD4Q96M96 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FGD4Q96M96 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
FGD4Q96M96 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms