Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD1

SGCZ, Zeta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCZQ96LD1 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SGCZQ96LD1 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SGCZQ96LD1 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SGCZQ96LD1 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SGCZQ96LD1 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SGCZQ96LD1 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SGCZQ96LD1 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SGCZQ96LD1 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SGCZQ96LD1 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SGCZQ96LD1 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SGCZQ96LD1 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SGCZQ96LD1 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SGCZQ96LD1 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SGCZQ96LD1 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SGCZQ96LD1 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SGCZQ96LD1 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SGCZQ96LD1 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SGCZQ96LD1 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SGCZQ96LD1 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SGCZQ96LD1 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SGCZQ96LD1 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SGCZQ96LD1 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SGCZQ96LD1 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SGCZQ96LD1 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SGCZQ96LD1 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SGCZQ96LD1 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SGCZQ96LD1 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SGCZQ96LD1 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SGCZQ96LD1 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SGCZQ96LD1 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SGCZQ96LD1 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SGCZQ96LD1 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SGCZQ96LD1 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SGCZQ96LD1 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SGCZQ96LD1 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SGCZQ96LD1 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SGCZQ96LD1 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SGCZQ96LD1 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SGCZQ96LD1 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SGCZQ96LD1 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SGCZQ96LD1 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SGCZQ96LD1 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SGCZQ96LD1 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SGCZQ96LD1 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SGCZQ96LD1 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SGCZQ96LD1 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SGCZQ96LD1 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SGCZQ96LD1 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SGCZQ96LD1 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SGCZQ96LD1 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SGCZQ96LD1 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SGCZQ96LD1 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SGCZQ96LD1 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SGCZQ96LD1 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SGCZQ96LD1 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SGCZQ96LD1 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SGCZQ96LD1 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SGCZQ96LD1 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SGCZQ96LD1 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SGCZQ96LD1 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SGCZQ96LD1 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SGCZQ96LD1 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SGCZQ96LD1 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
SGCZQ96LD1 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SGCZQ96LD1 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SGCZQ96LD1 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SGCZQ96LD1 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SGCZQ96LD1 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SGCZQ96LD1 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SGCZQ96LD1 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SGCZQ96LD1 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SGCZQ96LD1 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SGCZQ96LD1 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SGCZQ96LD1 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SGCZQ96LD1 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SGCZQ96LD1 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SGCZQ96LD1 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SGCZQ96LD1 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC15.06■□□□□ 0
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SGCZQ96LD1 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SGCZQ96LD1 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
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SGCZQ96LD1 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SGCZQ96LD1 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
SGCZQ96LD1 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SGCZQ96LD1 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SGCZQ96LD1 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SGCZQ96LD1 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SGCZQ96LD1 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SGCZQ96LD1 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SGCZQ96LD1 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SGCZQ96LD1 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
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SGCZQ96LD1 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SGCZQ96LD1 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SGCZQ96LD1 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SGCZQ96LD1 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SGCZQ96LD1 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SGCZQ96LD1 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SGCZQ96LD1 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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