Protein–RNA interactions for Protein: Q96JQ2

CLMN, Calmin, humanhuman

Predictions only

Length 1,002 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLMNQ96JQ2 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CLMNQ96JQ2 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CLMNQ96JQ2 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CLMNQ96JQ2 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CLMNQ96JQ2 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CLMNQ96JQ2 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CLMNQ96JQ2 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CLMNQ96JQ2 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CLMNQ96JQ2 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CLMNQ96JQ2 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CLMNQ96JQ2 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CLMNQ96JQ2 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CLMNQ96JQ2 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CLMNQ96JQ2 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CLMNQ96JQ2 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CLMNQ96JQ2 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CLMNQ96JQ2 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CLMNQ96JQ2 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CLMNQ96JQ2 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CLMNQ96JQ2 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CLMNQ96JQ2 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CLMNQ96JQ2 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CLMNQ96JQ2 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CLMNQ96JQ2 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CLMNQ96JQ2 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CLMNQ96JQ2 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CLMNQ96JQ2 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CLMNQ96JQ2 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CLMNQ96JQ2 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CLMNQ96JQ2 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CLMNQ96JQ2 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CLMNQ96JQ2 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CLMNQ96JQ2 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CLMNQ96JQ2 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CLMNQ96JQ2 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CLMNQ96JQ2 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CLMNQ96JQ2 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CLMNQ96JQ2 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CLMNQ96JQ2 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CLMNQ96JQ2 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
CLMNQ96JQ2 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
CLMNQ96JQ2 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CLMNQ96JQ2 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CLMNQ96JQ2 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CLMNQ96JQ2 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CLMNQ96JQ2 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CLMNQ96JQ2 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
CLMNQ96JQ2 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CLMNQ96JQ2 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CLMNQ96JQ2 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
CLMNQ96JQ2 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CLMNQ96JQ2 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CLMNQ96JQ2 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CLMNQ96JQ2 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
CLMNQ96JQ2 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CLMNQ96JQ2 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
CLMNQ96JQ2 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CLMNQ96JQ2 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CLMNQ96JQ2 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CLMNQ96JQ2 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CLMNQ96JQ2 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CLMNQ96JQ2 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CLMNQ96JQ2 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CLMNQ96JQ2 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CLMNQ96JQ2 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CLMNQ96JQ2 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
CLMNQ96JQ2 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CLMNQ96JQ2 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CLMNQ96JQ2 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CLMNQ96JQ2 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CLMNQ96JQ2 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CLMNQ96JQ2 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CLMNQ96JQ2 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
CLMNQ96JQ2 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CLMNQ96JQ2 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
CLMNQ96JQ2 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CLMNQ96JQ2 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CLMNQ96JQ2 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
CLMNQ96JQ2 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CLMNQ96JQ2 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CLMNQ96JQ2 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CLMNQ96JQ2 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CLMNQ96JQ2 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CLMNQ96JQ2 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CLMNQ96JQ2 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CLMNQ96JQ2 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CLMNQ96JQ2 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CLMNQ96JQ2 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CLMNQ96JQ2 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CLMNQ96JQ2 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CLMNQ96JQ2 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CLMNQ96JQ2 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CLMNQ96JQ2 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CLMNQ96JQ2 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CLMNQ96JQ2 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CLMNQ96JQ2 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CLMNQ96JQ2 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CLMNQ96JQ2 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CLMNQ96JQ2 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CLMNQ96JQ2 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms