Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB5

CDK5RAP3, CDK5 regulatory subunit-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP3Q96JB5 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CDK5RAP3Q96JB5 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CDK5RAP3Q96JB5 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CDK5RAP3Q96JB5 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CDK5RAP3Q96JB5 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CDK5RAP3Q96JB5 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CDK5RAP3Q96JB5 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CDK5RAP3Q96JB5 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CDK5RAP3Q96JB5 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CDK5RAP3Q96JB5 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CDK5RAP3Q96JB5 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CDK5RAP3Q96JB5 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CDK5RAP3Q96JB5 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CDK5RAP3Q96JB5 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CDK5RAP3Q96JB5 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CDK5RAP3Q96JB5 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CDK5RAP3Q96JB5 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
CDK5RAP3Q96JB5 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CDK5RAP3Q96JB5 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CDK5RAP3Q96JB5 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CDK5RAP3Q96JB5 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CDK5RAP3Q96JB5 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CDK5RAP3Q96JB5 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CDK5RAP3Q96JB5 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CDK5RAP3Q96JB5 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
CDK5RAP3Q96JB5 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CDK5RAP3Q96JB5 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CDK5RAP3Q96JB5 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CDK5RAP3Q96JB5 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CDK5RAP3Q96JB5 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CDK5RAP3Q96JB5 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CDK5RAP3Q96JB5 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CDK5RAP3Q96JB5 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CDK5RAP3Q96JB5 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CDK5RAP3Q96JB5 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CDK5RAP3Q96JB5 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CDK5RAP3Q96JB5 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CDK5RAP3Q96JB5 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CDK5RAP3Q96JB5 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CDK5RAP3Q96JB5 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CDK5RAP3Q96JB5 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CDK5RAP3Q96JB5 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
CDK5RAP3Q96JB5 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CDK5RAP3Q96JB5 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CDK5RAP3Q96JB5 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CDK5RAP3Q96JB5 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CDK5RAP3Q96JB5 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CDK5RAP3Q96JB5 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CDK5RAP3Q96JB5 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CDK5RAP3Q96JB5 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CDK5RAP3Q96JB5 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CDK5RAP3Q96JB5 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CDK5RAP3Q96JB5 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CDK5RAP3Q96JB5 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
CDK5RAP3Q96JB5 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CDK5RAP3Q96JB5 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
CDK5RAP3Q96JB5 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CDK5RAP3Q96JB5 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CDK5RAP3Q96JB5 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CDK5RAP3Q96JB5 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
CDK5RAP3Q96JB5 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CDK5RAP3Q96JB5 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CDK5RAP3Q96JB5 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CDK5RAP3Q96JB5 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CDK5RAP3Q96JB5 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CDK5RAP3Q96JB5 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CDK5RAP3Q96JB5 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CDK5RAP3Q96JB5 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CDK5RAP3Q96JB5 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CDK5RAP3Q96JB5 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CDK5RAP3Q96JB5 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CDK5RAP3Q96JB5 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CDK5RAP3Q96JB5 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CDK5RAP3Q96JB5 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CDK5RAP3Q96JB5 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CDK5RAP3Q96JB5 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CDK5RAP3Q96JB5 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CDK5RAP3Q96JB5 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CDK5RAP3Q96JB5 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CDK5RAP3Q96JB5 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CDK5RAP3Q96JB5 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CDK5RAP3Q96JB5 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CDK5RAP3Q96JB5 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CDK5RAP3Q96JB5 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CDK5RAP3Q96JB5 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CDK5RAP3Q96JB5 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CDK5RAP3Q96JB5 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CDK5RAP3Q96JB5 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CDK5RAP3Q96JB5 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CDK5RAP3Q96JB5 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CDK5RAP3Q96JB5 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CDK5RAP3Q96JB5 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CDK5RAP3Q96JB5 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CDK5RAP3Q96JB5 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CDK5RAP3Q96JB5 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CDK5RAP3Q96JB5 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CDK5RAP3Q96JB5 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms