Protein–RNA interactions for Protein: Q96CS3

FAF2, FAS-associated factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAF2Q96CS3 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAF2Q96CS3 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAF2Q96CS3 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAF2Q96CS3 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAF2Q96CS3 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAF2Q96CS3 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAF2Q96CS3 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAF2Q96CS3 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAF2Q96CS3 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAF2Q96CS3 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAF2Q96CS3 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAF2Q96CS3 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAF2Q96CS3 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAF2Q96CS3 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAF2Q96CS3 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAF2Q96CS3 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAF2Q96CS3 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAF2Q96CS3 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FAF2Q96CS3 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FAF2Q96CS3 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FAF2Q96CS3 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FAF2Q96CS3 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FAF2Q96CS3 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FAF2Q96CS3 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
FAF2Q96CS3 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FAF2Q96CS3 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FAF2Q96CS3 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FAF2Q96CS3 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FAF2Q96CS3 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FAF2Q96CS3 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FAF2Q96CS3 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FAF2Q96CS3 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FAF2Q96CS3 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FAF2Q96CS3 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FAF2Q96CS3 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FAF2Q96CS3 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FAF2Q96CS3 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FAF2Q96CS3 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FAF2Q96CS3 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FAF2Q96CS3 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
FAF2Q96CS3 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FAF2Q96CS3 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FAF2Q96CS3 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FAF2Q96CS3 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FAF2Q96CS3 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FAF2Q96CS3 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FAF2Q96CS3 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FAF2Q96CS3 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FAF2Q96CS3 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FAF2Q96CS3 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FAF2Q96CS3 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FAF2Q96CS3 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FAF2Q96CS3 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FAF2Q96CS3 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FAF2Q96CS3 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FAF2Q96CS3 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FAF2Q96CS3 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FAF2Q96CS3 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
FAF2Q96CS3 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.34
FAF2Q96CS3 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FAF2Q96CS3 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FAF2Q96CS3 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FAF2Q96CS3 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FAF2Q96CS3 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FAF2Q96CS3 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FAF2Q96CS3 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FAF2Q96CS3 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FAF2Q96CS3 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FAF2Q96CS3 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FAF2Q96CS3 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FAF2Q96CS3 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FAF2Q96CS3 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FAF2Q96CS3 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FAF2Q96CS3 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FAF2Q96CS3 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FAF2Q96CS3 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FAF2Q96CS3 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FAF2Q96CS3 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FAF2Q96CS3 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
FAF2Q96CS3 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FAF2Q96CS3 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FAF2Q96CS3 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FAF2Q96CS3 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FAF2Q96CS3 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FAF2Q96CS3 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
FAF2Q96CS3 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FAF2Q96CS3 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FAF2Q96CS3 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FAF2Q96CS3 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FAF2Q96CS3 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FAF2Q96CS3 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FAF2Q96CS3 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FAF2Q96CS3 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FAF2Q96CS3 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FAF2Q96CS3 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FAF2Q96CS3 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FAF2Q96CS3 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FAF2Q96CS3 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FAF2Q96CS3 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FAF2Q96CS3 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.7 ms