Protein–RNA interactions for Protein: Q96BF3

TMIGD2, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD2Q96BF3 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMIGD2Q96BF3 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMIGD2Q96BF3 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMIGD2Q96BF3 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMIGD2Q96BF3 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMIGD2Q96BF3 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMIGD2Q96BF3 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMIGD2Q96BF3 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMIGD2Q96BF3 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMIGD2Q96BF3 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMIGD2Q96BF3 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMIGD2Q96BF3 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMIGD2Q96BF3 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMIGD2Q96BF3 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMIGD2Q96BF3 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMIGD2Q96BF3 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMIGD2Q96BF3 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMIGD2Q96BF3 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMIGD2Q96BF3 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMIGD2Q96BF3 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
TMIGD2Q96BF3 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMIGD2Q96BF3 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMIGD2Q96BF3 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMIGD2Q96BF3 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMIGD2Q96BF3 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMIGD2Q96BF3 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMIGD2Q96BF3 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMIGD2Q96BF3 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
TMIGD2Q96BF3 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMIGD2Q96BF3 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMIGD2Q96BF3 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
TMIGD2Q96BF3 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMIGD2Q96BF3 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMIGD2Q96BF3 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMIGD2Q96BF3 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMIGD2Q96BF3 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMIGD2Q96BF3 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
TMIGD2Q96BF3 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMIGD2Q96BF3 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TMIGD2Q96BF3 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TMIGD2Q96BF3 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TMIGD2Q96BF3 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TMIGD2Q96BF3 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TMIGD2Q96BF3 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TMIGD2Q96BF3 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TMIGD2Q96BF3 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TMIGD2Q96BF3 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TMIGD2Q96BF3 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TMIGD2Q96BF3 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TMIGD2Q96BF3 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
TMIGD2Q96BF3 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TMIGD2Q96BF3 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TMIGD2Q96BF3 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMIGD2Q96BF3 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMIGD2Q96BF3 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMIGD2Q96BF3 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMIGD2Q96BF3 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMIGD2Q96BF3 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMIGD2Q96BF3 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMIGD2Q96BF3 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMIGD2Q96BF3 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMIGD2Q96BF3 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMIGD2Q96BF3 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMIGD2Q96BF3 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMIGD2Q96BF3 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMIGD2Q96BF3 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
TMIGD2Q96BF3 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMIGD2Q96BF3 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMIGD2Q96BF3 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMIGD2Q96BF3 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMIGD2Q96BF3 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMIGD2Q96BF3 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMIGD2Q96BF3 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMIGD2Q96BF3 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMIGD2Q96BF3 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMIGD2Q96BF3 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMIGD2Q96BF3 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
TMIGD2Q96BF3 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
TMIGD2Q96BF3 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMIGD2Q96BF3 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMIGD2Q96BF3 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
TMIGD2Q96BF3 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMIGD2Q96BF3 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
TMIGD2Q96BF3 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMIGD2Q96BF3 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMIGD2Q96BF3 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMIGD2Q96BF3 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMIGD2Q96BF3 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMIGD2Q96BF3 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMIGD2Q96BF3 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMIGD2Q96BF3 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMIGD2Q96BF3 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMIGD2Q96BF3 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMIGD2Q96BF3 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMIGD2Q96BF3 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMIGD2Q96BF3 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMIGD2Q96BF3 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMIGD2Q96BF3 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMIGD2Q96BF3 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMIGD2Q96BF3 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms