Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWX9

SELENOM, Selenoprotein M, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SELENOMQ8WWX9 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SELENOMQ8WWX9 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SELENOMQ8WWX9 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SELENOMQ8WWX9 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SELENOMQ8WWX9 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SELENOMQ8WWX9 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SELENOMQ8WWX9 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SELENOMQ8WWX9 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SELENOMQ8WWX9 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SELENOMQ8WWX9 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SELENOMQ8WWX9 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SELENOMQ8WWX9 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SELENOMQ8WWX9 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SELENOMQ8WWX9 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SELENOMQ8WWX9 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SELENOMQ8WWX9 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SELENOMQ8WWX9 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SELENOMQ8WWX9 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SELENOMQ8WWX9 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SELENOMQ8WWX9 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SELENOMQ8WWX9 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SELENOMQ8WWX9 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SELENOMQ8WWX9 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SELENOMQ8WWX9 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SELENOMQ8WWX9 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SELENOMQ8WWX9 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SELENOMQ8WWX9 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SELENOMQ8WWX9 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SELENOMQ8WWX9 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SELENOMQ8WWX9 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SELENOMQ8WWX9 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SELENOMQ8WWX9 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SELENOMQ8WWX9 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SELENOMQ8WWX9 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SELENOMQ8WWX9 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SELENOMQ8WWX9 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SELENOMQ8WWX9 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SELENOMQ8WWX9 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SELENOMQ8WWX9 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SELENOMQ8WWX9 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SELENOMQ8WWX9 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SELENOMQ8WWX9 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SELENOMQ8WWX9 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SELENOMQ8WWX9 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SELENOMQ8WWX9 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SELENOMQ8WWX9 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SELENOMQ8WWX9 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SELENOMQ8WWX9 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SELENOMQ8WWX9 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SELENOMQ8WWX9 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SELENOMQ8WWX9 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SELENOMQ8WWX9 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SELENOMQ8WWX9 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SELENOMQ8WWX9 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SELENOMQ8WWX9 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SELENOMQ8WWX9 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SELENOMQ8WWX9 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SELENOMQ8WWX9 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SELENOMQ8WWX9 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SELENOMQ8WWX9 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SELENOMQ8WWX9 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SELENOMQ8WWX9 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SELENOMQ8WWX9 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SELENOMQ8WWX9 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SELENOMQ8WWX9 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SELENOMQ8WWX9 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SELENOMQ8WWX9 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SELENOMQ8WWX9 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SELENOMQ8WWX9 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SELENOMQ8WWX9 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SELENOMQ8WWX9 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SELENOMQ8WWX9 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SELENOMQ8WWX9 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SELENOMQ8WWX9 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SELENOMQ8WWX9 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SELENOMQ8WWX9 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SELENOMQ8WWX9 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SELENOMQ8WWX9 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SELENOMQ8WWX9 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SELENOMQ8WWX9 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SELENOMQ8WWX9 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SELENOMQ8WWX9 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SELENOMQ8WWX9 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SELENOMQ8WWX9 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SELENOMQ8WWX9 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SELENOMQ8WWX9 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SELENOMQ8WWX9 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SELENOMQ8WWX9 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SELENOMQ8WWX9 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SELENOMQ8WWX9 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SELENOMQ8WWX9 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SELENOMQ8WWX9 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SELENOMQ8WWX9 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SELENOMQ8WWX9 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SELENOMQ8WWX9 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SELENOMQ8WWX9 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SELENOMQ8WWX9 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SELENOMQ8WWX9 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SELENOMQ8WWX9 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SELENOMQ8WWX9 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms