Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFR3

SPTSSB, Serine palmitoyltransferase small subunit B, humanhuman

Predictions only

Length 76 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTSSBQ8NFR3 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
SPTSSBQ8NFR3 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
SPTSSBQ8NFR3 POLE-207ENST00000535270 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
SPTSSBQ8NFR3 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
SPTSSBQ8NFR3 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
SPTSSBQ8NFR3 ATN1-201ENST00000356654 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
SPTSSBQ8NFR3 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
SPTSSBQ8NFR3 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
SPTSSBQ8NFR3 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
SPTSSBQ8NFR3 AP3S2-201ENST00000336418 5891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
SPTSSBQ8NFR3 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.05□□□□□ -0.96
SPTSSBQ8NFR3 BDNF-202ENST00000356660 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
SPTSSBQ8NFR3 BDNF-218ENST00000533246 4000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
SPTSSBQ8NFR3 ESR2-213ENST00000557772 5458 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
SPTSSBQ8NFR3 ALDH7A1-201ENST00000409134 4964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
SPTSSBQ8NFR3 TMEM104-204ENST00000582330 4679 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
SPTSSBQ8NFR3 ADAMTSL4-202ENST00000369038 4167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
SPTSSBQ8NFR3 CPNE5-201ENST00000244751 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
SPTSSBQ8NFR3 AC022497.1-201ENST00000624916 3691 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
SPTSSBQ8NFR3 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
SPTSSBQ8NFR3 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
SPTSSBQ8NFR3 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
SPTSSBQ8NFR3 PDE1C-205ENST00000396191 2952 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
SPTSSBQ8NFR3 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
SPTSSBQ8NFR3 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
SPTSSBQ8NFR3 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
SPTSSBQ8NFR3 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
SPTSSBQ8NFR3 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
SPTSSBQ8NFR3 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
SPTSSBQ8NFR3 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
SPTSSBQ8NFR3 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
SPTSSBQ8NFR3 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
SPTSSBQ8NFR3 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
SPTSSBQ8NFR3 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
SPTSSBQ8NFR3 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
SPTSSBQ8NFR3 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
SPTSSBQ8NFR3 CRY2-212ENST00000616623 4204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
SPTSSBQ8NFR3 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
SPTSSBQ8NFR3 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
SPTSSBQ8NFR3 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
SPTSSBQ8NFR3 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
SPTSSBQ8NFR3 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC9.05□□□□□ -0.96
SPTSSBQ8NFR3 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
SPTSSBQ8NFR3 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
SPTSSBQ8NFR3 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
SPTSSBQ8NFR3 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
SPTSSBQ8NFR3 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC9.05□□□□□ -0.96
SPTSSBQ8NFR3 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC9.05□□□□□ -0.96
SPTSSBQ8NFR3 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
SPTSSBQ8NFR3 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
SPTSSBQ8NFR3 SCN8A-208ENST00000599343 5976 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
SPTSSBQ8NFR3 TCF4-202ENST00000356073 8317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
SPTSSBQ8NFR3 CACNA2D2-202ENST00000360963 5272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
SPTSSBQ8NFR3 PLEKHA7-202ENST00000355661 4980 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
SPTSSBQ8NFR3 CEP170-204ENST00000366544 6805 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
SPTSSBQ8NFR3 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
SPTSSBQ8NFR3 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
SPTSSBQ8NFR3 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
SPTSSBQ8NFR3 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
SPTSSBQ8NFR3 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
SPTSSBQ8NFR3 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
SPTSSBQ8NFR3 SPPL2B-209ENST00000613503 3456 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
SPTSSBQ8NFR3 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
SPTSSBQ8NFR3 SDC1-202ENST00000381150 3291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
SPTSSBQ8NFR3 PER1-211ENST00000581082 4521 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
SPTSSBQ8NFR3 AREL1-201ENST00000356357 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
SPTSSBQ8NFR3 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
SPTSSBQ8NFR3 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
SPTSSBQ8NFR3 TBC1D16-201ENST00000310924 10936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
SPTSSBQ8NFR3 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
SPTSSBQ8NFR3 OTOF-203ENST00000339598 4756 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
SPTSSBQ8NFR3 DAPK1-201ENST00000358077 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
SPTSSBQ8NFR3 MANBA-202ENST00000505239 2577 ntTSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
SPTSSBQ8NFR3 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
SPTSSBQ8NFR3 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
SPTSSBQ8NFR3 AL033529.1-201ENST00000480336 3447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
SPTSSBQ8NFR3 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
SPTSSBQ8NFR3 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
SPTSSBQ8NFR3 OPRK1-201ENST00000265572 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
SPTSSBQ8NFR3 SLC23A1-201ENST00000348729 2299 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
SPTSSBQ8NFR3 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
SPTSSBQ8NFR3 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
SPTSSBQ8NFR3 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC9.04□□□□□ -0.96
SPTSSBQ8NFR3 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
SPTSSBQ8NFR3 IFNLR1-201ENST00000327535 4549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
SPTSSBQ8NFR3 TVP23C-CDRT4-203ENST00000522212 2833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.04□□□□□ -0.96
SPTSSBQ8NFR3 TNS3-201ENST00000311160 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
SPTSSBQ8NFR3 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
SPTSSBQ8NFR3 RLIM-202ENST00000349225 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.04□□□□□ -0.96
SPTSSBQ8NFR3 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
SPTSSBQ8NFR3 CREBBP-202ENST00000382070 7598 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
SPTSSBQ8NFR3 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC9.04□□□□□ -0.96
SPTSSBQ8NFR3 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
SPTSSBQ8NFR3 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
SPTSSBQ8NFR3 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
SPTSSBQ8NFR3 INF2-209ENST00000617571 2956 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
SPTSSBQ8NFR3 PRKN-206ENST00000366898 4180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
SPTSSBQ8NFR3 C15orf41-208ENST00000566621 2866 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
SPTSSBQ8NFR3 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
SPTSSBQ8NFR3 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms