Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCD3

HJURP, Holliday junction recognition protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HJURPQ8NCD3 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HJURPQ8NCD3 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HJURPQ8NCD3 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HJURPQ8NCD3 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HJURPQ8NCD3 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HJURPQ8NCD3 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HJURPQ8NCD3 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HJURPQ8NCD3 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HJURPQ8NCD3 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HJURPQ8NCD3 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HJURPQ8NCD3 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HJURPQ8NCD3 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HJURPQ8NCD3 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HJURPQ8NCD3 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
HJURPQ8NCD3 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HJURPQ8NCD3 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HJURPQ8NCD3 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HJURPQ8NCD3 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HJURPQ8NCD3 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HJURPQ8NCD3 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HJURPQ8NCD3 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HJURPQ8NCD3 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HJURPQ8NCD3 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HJURPQ8NCD3 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HJURPQ8NCD3 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
HJURPQ8NCD3 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HJURPQ8NCD3 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HJURPQ8NCD3 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HJURPQ8NCD3 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HJURPQ8NCD3 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HJURPQ8NCD3 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HJURPQ8NCD3 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HJURPQ8NCD3 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HJURPQ8NCD3 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HJURPQ8NCD3 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HJURPQ8NCD3 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HJURPQ8NCD3 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HJURPQ8NCD3 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HJURPQ8NCD3 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HJURPQ8NCD3 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HJURPQ8NCD3 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
HJURPQ8NCD3 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HJURPQ8NCD3 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HJURPQ8NCD3 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HJURPQ8NCD3 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HJURPQ8NCD3 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HJURPQ8NCD3 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HJURPQ8NCD3 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HJURPQ8NCD3 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HJURPQ8NCD3 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HJURPQ8NCD3 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HJURPQ8NCD3 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HJURPQ8NCD3 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HJURPQ8NCD3 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
HJURPQ8NCD3 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HJURPQ8NCD3 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
HJURPQ8NCD3 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HJURPQ8NCD3 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HJURPQ8NCD3 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HJURPQ8NCD3 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HJURPQ8NCD3 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HJURPQ8NCD3 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HJURPQ8NCD3 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HJURPQ8NCD3 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HJURPQ8NCD3 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HJURPQ8NCD3 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HJURPQ8NCD3 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HJURPQ8NCD3 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
HJURPQ8NCD3 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HJURPQ8NCD3 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HJURPQ8NCD3 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HJURPQ8NCD3 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HJURPQ8NCD3 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HJURPQ8NCD3 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HJURPQ8NCD3 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HJURPQ8NCD3 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HJURPQ8NCD3 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HJURPQ8NCD3 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HJURPQ8NCD3 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HJURPQ8NCD3 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HJURPQ8NCD3 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HJURPQ8NCD3 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HJURPQ8NCD3 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HJURPQ8NCD3 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HJURPQ8NCD3 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HJURPQ8NCD3 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HJURPQ8NCD3 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
HJURPQ8NCD3 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HJURPQ8NCD3 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HJURPQ8NCD3 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HJURPQ8NCD3 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HJURPQ8NCD3 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HJURPQ8NCD3 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HJURPQ8NCD3 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HJURPQ8NCD3 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HJURPQ8NCD3 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HJURPQ8NCD3 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HJURPQ8NCD3 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HJURPQ8NCD3 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HJURPQ8NCD3 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms