Protein–RNA interactions for Protein: Q8N398

VWA5B2, von Willebrand factor A domain-containing protein 5B2, humanhuman

Predictions only

Length 1,253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA5B2Q8N398 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
VWA5B2Q8N398 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
VWA5B2Q8N398 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
VWA5B2Q8N398 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
VWA5B2Q8N398 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
VWA5B2Q8N398 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
VWA5B2Q8N398 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
VWA5B2Q8N398 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VWA5B2Q8N398 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VWA5B2Q8N398 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VWA5B2Q8N398 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VWA5B2Q8N398 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VWA5B2Q8N398 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VWA5B2Q8N398 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VWA5B2Q8N398 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VWA5B2Q8N398 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VWA5B2Q8N398 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VWA5B2Q8N398 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VWA5B2Q8N398 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VWA5B2Q8N398 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VWA5B2Q8N398 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
VWA5B2Q8N398 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
VWA5B2Q8N398 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VWA5B2Q8N398 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VWA5B2Q8N398 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VWA5B2Q8N398 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VWA5B2Q8N398 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VWA5B2Q8N398 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VWA5B2Q8N398 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VWA5B2Q8N398 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
VWA5B2Q8N398 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
VWA5B2Q8N398 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VWA5B2Q8N398 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VWA5B2Q8N398 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VWA5B2Q8N398 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VWA5B2Q8N398 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VWA5B2Q8N398 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VWA5B2Q8N398 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VWA5B2Q8N398 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VWA5B2Q8N398 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VWA5B2Q8N398 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VWA5B2Q8N398 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VWA5B2Q8N398 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VWA5B2Q8N398 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VWA5B2Q8N398 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VWA5B2Q8N398 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VWA5B2Q8N398 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VWA5B2Q8N398 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VWA5B2Q8N398 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VWA5B2Q8N398 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VWA5B2Q8N398 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VWA5B2Q8N398 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VWA5B2Q8N398 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VWA5B2Q8N398 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VWA5B2Q8N398 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VWA5B2Q8N398 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VWA5B2Q8N398 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VWA5B2Q8N398 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VWA5B2Q8N398 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VWA5B2Q8N398 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VWA5B2Q8N398 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
VWA5B2Q8N398 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VWA5B2Q8N398 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VWA5B2Q8N398 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VWA5B2Q8N398 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VWA5B2Q8N398 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VWA5B2Q8N398 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VWA5B2Q8N398 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VWA5B2Q8N398 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VWA5B2Q8N398 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VWA5B2Q8N398 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VWA5B2Q8N398 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VWA5B2Q8N398 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VWA5B2Q8N398 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
VWA5B2Q8N398 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VWA5B2Q8N398 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VWA5B2Q8N398 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VWA5B2Q8N398 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VWA5B2Q8N398 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VWA5B2Q8N398 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VWA5B2Q8N398 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VWA5B2Q8N398 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VWA5B2Q8N398 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VWA5B2Q8N398 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VWA5B2Q8N398 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VWA5B2Q8N398 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VWA5B2Q8N398 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VWA5B2Q8N398 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VWA5B2Q8N398 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VWA5B2Q8N398 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VWA5B2Q8N398 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VWA5B2Q8N398 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VWA5B2Q8N398 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VWA5B2Q8N398 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VWA5B2Q8N398 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VWA5B2Q8N398 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VWA5B2Q8N398 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VWA5B2Q8N398 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VWA5B2Q8N398 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VWA5B2Q8N398 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms