Protein–RNA interactions for Protein: Q6STE5

SMARCD3, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 3, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCD3Q6STE5 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMARCD3Q6STE5 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMARCD3Q6STE5 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMARCD3Q6STE5 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMARCD3Q6STE5 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMARCD3Q6STE5 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMARCD3Q6STE5 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SMARCD3Q6STE5 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMARCD3Q6STE5 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMARCD3Q6STE5 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMARCD3Q6STE5 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMARCD3Q6STE5 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMARCD3Q6STE5 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMARCD3Q6STE5 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMARCD3Q6STE5 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMARCD3Q6STE5 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMARCD3Q6STE5 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMARCD3Q6STE5 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SMARCD3Q6STE5 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SMARCD3Q6STE5 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMARCD3Q6STE5 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMARCD3Q6STE5 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMARCD3Q6STE5 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMARCD3Q6STE5 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMARCD3Q6STE5 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMARCD3Q6STE5 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SMARCD3Q6STE5 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMARCD3Q6STE5 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMARCD3Q6STE5 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMARCD3Q6STE5 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMARCD3Q6STE5 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SMARCD3Q6STE5 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMARCD3Q6STE5 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SMARCD3Q6STE5 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMARCD3Q6STE5 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMARCD3Q6STE5 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMARCD3Q6STE5 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMARCD3Q6STE5 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMARCD3Q6STE5 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMARCD3Q6STE5 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMARCD3Q6STE5 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMARCD3Q6STE5 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMARCD3Q6STE5 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMARCD3Q6STE5 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMARCD3Q6STE5 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMARCD3Q6STE5 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMARCD3Q6STE5 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMARCD3Q6STE5 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMARCD3Q6STE5 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMARCD3Q6STE5 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMARCD3Q6STE5 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMARCD3Q6STE5 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMARCD3Q6STE5 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMARCD3Q6STE5 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMARCD3Q6STE5 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMARCD3Q6STE5 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMARCD3Q6STE5 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMARCD3Q6STE5 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMARCD3Q6STE5 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMARCD3Q6STE5 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMARCD3Q6STE5 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMARCD3Q6STE5 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMARCD3Q6STE5 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMARCD3Q6STE5 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMARCD3Q6STE5 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMARCD3Q6STE5 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMARCD3Q6STE5 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMARCD3Q6STE5 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMARCD3Q6STE5 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMARCD3Q6STE5 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SMARCD3Q6STE5 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMARCD3Q6STE5 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMARCD3Q6STE5 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMARCD3Q6STE5 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMARCD3Q6STE5 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMARCD3Q6STE5 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMARCD3Q6STE5 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SMARCD3Q6STE5 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMARCD3Q6STE5 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMARCD3Q6STE5 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMARCD3Q6STE5 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMARCD3Q6STE5 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMARCD3Q6STE5 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMARCD3Q6STE5 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMARCD3Q6STE5 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMARCD3Q6STE5 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMARCD3Q6STE5 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMARCD3Q6STE5 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMARCD3Q6STE5 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMARCD3Q6STE5 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMARCD3Q6STE5 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMARCD3Q6STE5 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMARCD3Q6STE5 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMARCD3Q6STE5 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMARCD3Q6STE5 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMARCD3Q6STE5 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMARCD3Q6STE5 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMARCD3Q6STE5 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMARCD3Q6STE5 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMARCD3Q6STE5 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms