Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1M0

SLC27A4, Long-chain fatty acid transport protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A4Q6P1M0 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC27A4Q6P1M0 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC27A4Q6P1M0 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC27A4Q6P1M0 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC27A4Q6P1M0 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC27A4Q6P1M0 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC27A4Q6P1M0 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC27A4Q6P1M0 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC27A4Q6P1M0 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC27A4Q6P1M0 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SLC27A4Q6P1M0 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC27A4Q6P1M0 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC27A4Q6P1M0 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC27A4Q6P1M0 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC27A4Q6P1M0 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC27A4Q6P1M0 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC27A4Q6P1M0 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC27A4Q6P1M0 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC27A4Q6P1M0 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC27A4Q6P1M0 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC27A4Q6P1M0 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC27A4Q6P1M0 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC27A4Q6P1M0 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC27A4Q6P1M0 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC27A4Q6P1M0 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC27A4Q6P1M0 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC27A4Q6P1M0 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC27A4Q6P1M0 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC27A4Q6P1M0 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SLC27A4Q6P1M0 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC27A4Q6P1M0 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC27A4Q6P1M0 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC27A4Q6P1M0 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC27A4Q6P1M0 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC27A4Q6P1M0 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC27A4Q6P1M0 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC27A4Q6P1M0 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC27A4Q6P1M0 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SLC27A4Q6P1M0 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC27A4Q6P1M0 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC27A4Q6P1M0 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SLC27A4Q6P1M0 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC27A4Q6P1M0 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC27A4Q6P1M0 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC27A4Q6P1M0 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC27A4Q6P1M0 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC27A4Q6P1M0 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC27A4Q6P1M0 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC27A4Q6P1M0 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC27A4Q6P1M0 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC27A4Q6P1M0 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC27A4Q6P1M0 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC27A4Q6P1M0 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC27A4Q6P1M0 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC27A4Q6P1M0 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC27A4Q6P1M0 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC27A4Q6P1M0 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC27A4Q6P1M0 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC27A4Q6P1M0 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC27A4Q6P1M0 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC27A4Q6P1M0 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC27A4Q6P1M0 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.05■□□□□ 0
SLC27A4Q6P1M0 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SLC27A4Q6P1M0 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
SLC27A4Q6P1M0 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC15.05■□□□□ 0
SLC27A4Q6P1M0 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SLC27A4Q6P1M0 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SLC27A4Q6P1M0 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SLC27A4Q6P1M0 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
SLC27A4Q6P1M0 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SLC27A4Q6P1M0 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SLC27A4Q6P1M0 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SLC27A4Q6P1M0 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SLC27A4Q6P1M0 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SLC27A4Q6P1M0 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SLC27A4Q6P1M0 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SLC27A4Q6P1M0 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SLC27A4Q6P1M0 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SLC27A4Q6P1M0 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SLC27A4Q6P1M0 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SLC27A4Q6P1M0 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SLC27A4Q6P1M0 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SLC27A4Q6P1M0 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SLC27A4Q6P1M0 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SLC27A4Q6P1M0 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SLC27A4Q6P1M0 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SLC27A4Q6P1M0 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SLC27A4Q6P1M0 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SLC27A4Q6P1M0 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SLC27A4Q6P1M0 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SLC27A4Q6P1M0 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SLC27A4Q6P1M0 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SLC27A4Q6P1M0 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SLC27A4Q6P1M0 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SLC27A4Q6P1M0 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SLC27A4Q6P1M0 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SLC27A4Q6P1M0 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SLC27A4Q6P1M0 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SLC27A4Q6P1M0 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SLC27A4Q6P1M0 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms