Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWN6

FAM208B, Protein FAM208B, humanhuman

Predictions only

Length 2,430 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM208BQ5VWN6 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FAM208BQ5VWN6 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FAM208BQ5VWN6 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
FAM208BQ5VWN6 TMEM219-204ENST00000566848 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FAM208BQ5VWN6 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FAM208BQ5VWN6 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FAM208BQ5VWN6 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FAM208BQ5VWN6 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
FAM208BQ5VWN6 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FAM208BQ5VWN6 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FAM208BQ5VWN6 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FAM208BQ5VWN6 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FAM208BQ5VWN6 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FAM208BQ5VWN6 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FAM208BQ5VWN6 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FAM208BQ5VWN6 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FAM208BQ5VWN6 SLC44A3-209ENST00000532427 1912 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FAM208BQ5VWN6 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FAM208BQ5VWN6 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FAM208BQ5VWN6 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FAM208BQ5VWN6 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FAM208BQ5VWN6 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FAM208BQ5VWN6 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FAM208BQ5VWN6 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FAM208BQ5VWN6 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
FAM208BQ5VWN6 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FAM208BQ5VWN6 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FAM208BQ5VWN6 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FAM208BQ5VWN6 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FAM208BQ5VWN6 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FAM208BQ5VWN6 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
FAM208BQ5VWN6 DNM1P30-201ENST00000563586 452 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
FAM208BQ5VWN6 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FAM208BQ5VWN6 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FAM208BQ5VWN6 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FAM208BQ5VWN6 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FAM208BQ5VWN6 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM208BQ5VWN6 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM208BQ5VWN6 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM208BQ5VWN6 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM208BQ5VWN6 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM208BQ5VWN6 SNX15-201ENST00000352068 771 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM208BQ5VWN6 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM208BQ5VWN6 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM208BQ5VWN6 MRPL49-209ENST00000534078 518 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM208BQ5VWN6 CRTC3-AS1-202ENST00000559531 657 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM208BQ5VWN6 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM208BQ5VWN6 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM208BQ5VWN6 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM208BQ5VWN6 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM208BQ5VWN6 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM208BQ5VWN6 AC233280.19-201ENST00000633223 136 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM208BQ5VWN6 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM208BQ5VWN6 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM208BQ5VWN6 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM208BQ5VWN6 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM208BQ5VWN6 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM208BQ5VWN6 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM208BQ5VWN6 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM208BQ5VWN6 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM208BQ5VWN6 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM208BQ5VWN6 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM208BQ5VWN6 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM208BQ5VWN6 HFE-203ENST00000336625 804 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM208BQ5VWN6 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM208BQ5VWN6 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM208BQ5VWN6 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM208BQ5VWN6 AL008733.1-201ENST00000440516 469 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM208BQ5VWN6 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM208BQ5VWN6 AC004540.1-204ENST00000449537 727 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM208BQ5VWN6 AL118516.1-201ENST00000564152 670 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM208BQ5VWN6 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM208BQ5VWN6 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM208BQ5VWN6 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM208BQ5VWN6 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM208BQ5VWN6 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM208BQ5VWN6 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM208BQ5VWN6 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM208BQ5VWN6 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM208BQ5VWN6 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM208BQ5VWN6 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM208BQ5VWN6 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM208BQ5VWN6 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM208BQ5VWN6 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FAM208BQ5VWN6 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FAM208BQ5VWN6 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FAM208BQ5VWN6 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FAM208BQ5VWN6 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FAM208BQ5VWN6 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FAM208BQ5VWN6 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FAM208BQ5VWN6 Metazoa_SRP.100-201ENST00000447610 282 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
FAM208BQ5VWN6 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FAM208BQ5VWN6 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FAM208BQ5VWN6 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FAM208BQ5VWN6 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FAM208BQ5VWN6 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FAM208BQ5VWN6 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FAM208BQ5VWN6 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FAM208BQ5VWN6 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FAM208BQ5VWN6 SCAF11-203ENST00000395453 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms